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领域: | 多组学/蛋白质组/代谢组/脂质组 | ||
样品: | Hela细胞 | 项目: | 定量蛋白质组学 |
方案文件名 | 下载 |
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Orbitrap Exploris平台FAIMS-DIA蛋白质组学快速定量分析 |
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数据非依赖性采集(Data-Independent Acquisition,DIA)是当前
蛋白质组学中应用范围较广的定量方式。DIA扫描模式中,超高分
辨质谱将一级质谱的质荷比范围分为若干窗口,快速地对特定质量
范围内所有母离子进行碎裂并采集碎片离子。相比于传统的DDA方
法,DIA定量有更好的重现性及准确性,DIA也更加适用于大队列定
量蛋白质组学研究[1]。
作为应用于大队列的定量蛋白质组学研究策略,拥有一个更高效更
稳定的解析平台尤为重要。Orbitrap Exploris系列质谱是赛默飞世
尔科技公司从 2019 年推出的全新静电场轨道阱超高分辨质谱仪平
台,采用全新的设计,让仪器具有更佳的性能和更高的稳定性,
并且能够兼容FAIMS Pro接口,进一步提高检测灵敏度和抗污染能
力。本文使用 Orbitrap Exploris 480质谱,对Hela细胞蛋白质组和
血浆蛋白质组进行DIA及FAIMS-DIA定量分析,考察 Orbitrap Explo-
ris 480的DIA定量能力。