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参考报价: | 面议 | 型号: | Pyrosequencing甲基化检测服务 |
品牌: | 伯豪生物 | 产地: | 上海 |
关注度: | 11 | 信息完整度: | |
样本: | 典型用户: | 暂无 |
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焦磷酸测序技术(Pyrosequencing)作为一种新的序列分析技术,能够快速地检测甲基化的频率,对样品中的甲基化位点进行定性及定量检测,为甲基化研究提供了新的途径。上海伯豪为您提供基于QIAGEN公司焦磷酸测序平台的服务。
一、焦磷酸测序技术原理
焦磷酸测序技术是由4种酶(DNA 聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶和三磷酸腺苷双磷酸酶)催化的同一反应体系中的酶级联化学发光反应。具体过程如下:
1.仪器向待检测样品中每次只加入一个核苷酸碱基(dNTP)
2.互补的碱基结合在模板上时,会释放出焦磷酸基团Pyrophosphate (PPi)
3.PPi在ATP硫酸化酶(ATP Sulfurylase)作用下,合成ATP,ATP作为能量分子,驱动荧光素在荧光素酶(Luciferase)的催化下转化为氧化荧光素,并发出与ATP能量成正比的荧光信号
4.信号被CCD数码相机捕捉,形成峰形PyrogramTM
5.未与模板结合的碱基将被三磷酸腺苷双磷酸酶(Apyrase)降解
6.加入下一种dNTP
二、焦磷酸测序实验流程
三、焦磷酸测序在DNA甲基化中的应用
1.基因组整体水平的甲基化检测
2.特异位点的甲基化检测
3.寻找新的甲基化位点
四、焦磷酸测序结果展示
五、 案例分析
焦磷酸测序检测宫颈癌中UTF1启动子区域甲基化水平
研究者利用Illumina HumanMethylation27芯片对9例样本(4例正常,5例宫颈癌)进行全基因组启动子区甲基化扫描,结果显示宫颈癌患者UTF1启动子区域呈现出高的甲基化状态。为了验证芯片筛选的结果,采用焦磷酸测序方法首先对这些样本的UTF1启动子区域进行深入分析,结果表明正常宫颈中UTF1启动子区域呈现低甲基化状态,而相同的位点在SCC中呈现高甲基化状态。为了进一步验证,研究者扩大样本量,对47例不同类型的石蜡包埋组织样本及10例白细胞进行焦磷酸测序检测,与之前的结论保持一致。结合RNA水平和蛋白水平的实验,研究者最后提出UTF1启动子甲基化状态可以作为宫颈癌诊断的一个重要的分子标志物。
原文:Aberrant Promoter Methylation and Expression of UTF1 during Cervical Carcinogenesi. Plos One. 2012 ,7(8):e42704.
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