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转录组测序及分析,数据深入挖掘
Illumina 2500 高通量测序平台,通过信息分析,可获得基因表达差异信息、SNP分析、预测新转录本等信息,为研究基因的结构和基因的表达调控提供了重要的手段。
分析流程及内容:
标准信息分析
l 对原始数据进行去除接头和低质量reads的处理
l 测序评估
l 基因表达注释
l 基因差异表达分析
l 预测新转录本
l 等位基因差异表达分析(需正反交实验设计)
无参考序列信息分析
l 对原始数据进行去除接头序列及低质量reads的处理;
l 数据产出统计及测序数据的成分和质量评估;
l 组装结果分析(Contig长度分布、Unigene*长度分布);
l Unigene 功能注释及COG分类;
l Unigene 的GO分类;
l Unigene 代谢通路分析;
l 预测编码蛋白框(CDS);
l Unigene 表达差异分析;
l Unigene 在样品间的差异GO分类和Pathway 富集性分析;
l SNP 分析;
l SSR 开发及引物设计;
l 主成分分析(五个或五个以上样品);
l 条件特异表达分析(五个或五个以上样品)
可根据需求进行个性化分析,提供分析代码,客户可重现分析。
另:提供单细胞测序、LncRNA测序等。
转录组分析,数据深入挖掘信息由西农生(北京)生物技术有限公司为您提供,如您想了解更多关于转录组分析,数据深入挖掘报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途