MeDIP-Seq测序方案

 利用甲基化核苷酸抗体对甲基化片段进行富集，然后利用Hiseq2000测序平台进行100PE测序，能够针对性的对甲基化区域进行深度的测序，分析基因组中高度甲基化的基因序列，在基因组整体水平上进行分析，研究与疾病或性状相关的差异甲基化区域。

一、技术优势：

检测范围广：覆盖整个基因组范围的甲基化区域。

高性价比：基于抗体富集原理的测序方法，可以较低的成本进行多样品间的全基因组DNA。甲基化差异分析，特别适用于大样本量的疾病表观研究。

二、标准信息分析内容包括：

1.MeDIP-seq序列与参考序列的比对。

2.MeDIP-seq序列数据在全基因组的分布趋势

    2.1 MeDIP-seq测序reads在全基因组上的覆盖深度

    2.2 MeDIP-seq测序reads在CpG位点上的覆盖深度

    2.3 MeDIP-seq测序reads在不同基因功能元件上的分布

    2.4 MeDIP-seq测序reads在不同GC含量区域中的分布

3.统计MeDIP-seq序列富集区域（peak）的信息；

    3.1 Peak扫描

    3.2 寻找Peak相关基因

    3.3统计Peak在不同基因功能元件上的分布

4.基于peak的多样品间差异分析

    4.1 分析各样品间的peak相关差异基因

    4.2 对各样品间的差异基因进行GO功能富集分析及pathway功能分析

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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途