染色质免疫共沉淀（ChIP）

 

染色质免疫共沉淀（ChIP）是在体内环境中研究蛋白质与DNA相互作用的经典实验方法，广泛应用于组蛋白修饰、特定转录因子的基因调控作用等相关领域。随着新一代测序技术的发展和成熟，染色质免疫沉淀实验与高通量测序的整合——Chromatin Immunoprecipitation Sequencing （ChIP Sequencing ），可在全基因组范围对蛋白结合位点进行高效而准确的筛选与鉴定，同时也为研究的深入开展打下基础。
       采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后，分离与其结合的基因组DNA片段，再通过高通量测序与数据分析，在全基因组范围内寻找目的蛋白的DNA结合位点，并且可以基于多个样品进行差异比较。

技术优势:

检测范围广：全基因组范围的免疫沉淀与测序分析；

高性价比：基于抗体富集目标区域，有效降低测序数据量；

微量样本：只需10 ng以上免疫沉淀后的DNA，即可进行测序分析。

研究内容:
一、标准信息分析 
1)         去接头污染，去低质量reads和产量情况统计；
2)         ChIP 测序序列与参考基因组序列的比对；
3)         ChIP 测序Reads 在全基因组的分布；
4)         统计ChIP测序数据富集区域( Peak ) 的信息；
5)         Peak相关基因筛选与GO功能聚类分析；
6)         多个样品的差异分析；
7)         UCSC Genome Browser使用说明；
二、高级信息分析
 不同表达水平的基因在TSS附近区域的reads 富集程度。
三、定制化信息分析
可结合客户的需求，协商确定定制化信息分析内容。 
 

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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途