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传统的真菌分类鉴定主要是按照真菌的形态、生长以及生理生化等特征对真菌进行分类。然而真菌的种类繁多,个体多态性明显,而且其生长、生理生化特征也会随着环境的变化而不稳定。因此,采用传统的方法对真菌进行正确的分类存在较大的困难。随着分子生物学技术的发展,核酸序列分析已被广泛的应用于真菌分类鉴定中,目前常用的技术包括18S rDNA、ITS(Internal Transcribed Spacer,ITS)及18S rDNA-ITS序列分析技术。
18S rDNA是编码真核生物核糖体小亚基rRNA(18S rRNA)的DNA序列,序列中既有保守区又有可变区,保守序列区域反映了生物物种间的亲缘关系,而高变序列区域则能体现物种间的差异。由于18S rDNA在进化速率上比较保守,因此在系统发育研究中较适用于种级以上阶元的分类。内转录间隔区ITS位于核糖体rDNA 18S、5.8S及28S之间,由于不需要加入成熟核糖体,因此在进化过程中能够承受更多的变异,其进化速率为18S rDNA的10倍,属于中度保守的区域,利用它可研究种及种以下的分类阶元。另外,也可通过选择引物同时扩增18 S rDNA和ITS,通过分析18 S rDNA序列,先在较高级别上确定样品的归属,然后根据ITS 序列,将真菌归类到种或亚种水平。
提供结果
1. 结题报告,包括实验流程,PCR产物电泳图、进化树结果等
2. 测序峰图文件
3. 序列文件
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