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蛋白质定性研究
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各个物种的基因组测序相继完成,如人类基因组,涵盖了20300个蛋白质编码基因。然而基因所包含的遗传信息,并不直接参与生命活动,而是通过控制蛋白质的表达和功能,间接指导生命活动。相比基因组而言,生命体中蛋白质的表达时空上更为动态,多样,也更加直接地反映了机体的生理状况,因而对基因组编码的蛋白质进行定性和定量研究,将帮助我们更好地解读基因组信息,进一步解释生命活动和疾病发生发展机理。针对一个组织或者细胞基因组表达的全部蛋白质进行研究,即蛋白质组学(Proteome)。根据样品类型不同,可以分为全谱分析、SDS-PAGE胶条以及混合蛋白质溶液分析等类型。蛋白质组学的分析过程包括样品的制备和处理、蛋白质的酶解、分离、质谱鉴定、数据分析和评估等过程。质谱技术具有高灵敏度,高精度和高通量等特点,且能与上游的分离技术(比如色谱技术,凝胶技术)联用,因而是蛋白质组学研究中的对蛋白质进行定性和定量的关键技术。

实验流程


技术平台

 

Triple TOF 5600, Q-Exactive, Orbitrap Fusion™和 Tribrid


技术优势

    高通量、自动化程度高、分离能力强; 

    兼容性强(可分析蛋白质条带、组织提取液、全细胞裂解液、亚细胞分离组分等)。 

应用领域

     蛋白质表达谱和混合蛋白质的鉴定 

    相互作用蛋白质的鉴定 

    稀有物种的蛋白质组鉴定 

参考文献 

[1] Wilhelm, M., et al. (2014) Mass-spectrometry-based draft of the human  proteome . Nature 509, 582-587 

[2] Kim, M.S., et al. (2014) A draft map of the human proteome. Nature 509, 575-581 

[3] Gao, X., et al. (2015) Large-scale identification of encystment-related  proteins  and genes in Pseudourostyla cristata. Scientific reports 5, 11360 

 

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