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相对定量蛋白质组学(SILAC)

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AI问答
可以做哪些实验,检测什么? 可以用哪些耗材和试剂?

        SILAC(stable-isotope labelling by amino acids in cell culture)技术,指多组细胞同时培养,比如,A和B组,A组是在包含正常氨基酸(light)的培养基中;B组的培养基则含有“重型 (heavy)”的氨基酸,即稳定同位素标记的氨基酸。细胞5-6代后,稳定同位素标记的氨基酸完全掺入到蛋白中,取代了原有的氨基酸。这样,两个蛋白之 间就存在分子量的改变,而其它化学性质无异。然后将两组细胞混合,提取出蛋白质,质谱进行测定。通过比较质谱图中肽段信号峰的峰面积大小进行相对定量研 究。该技术适用于细胞和动物的体内标记,具有系统误差小,定量准确,并且可以进一步寻找具有时效性变化的差异蛋白,更精准地研究刺激的作用机理等技术特点。

细胞实验流程

动物实验流程

 
技术平台
       Triple TOF 5600, Q-Exactive, Orbitrap Fusion™ Tribrid™

技术优势

  •    高通量:可同时鉴定并定量数百至数千种蛋白质;    
  •     定量精确:降低由于样品制备不同而造成的实验差异;    
  •     线性定量范围广;    
  •     灵敏度更高:蛋白质需要量明显减少;
  •    重要的体内标记技术,更接近样品真实状态,适用于培养细胞或者小鼠蛋白质表达动态变化研究。

应用领域

  •    机理和调控机制研究  动态过程中机制研究 
  •    疾病标志物的筛选   用药及预后标志物筛选

参考文献
Geoghegan, V., et al. (2015) Comprehensive identification of arginine methylation in primary T cells reveals regulatory roles in cell signalling. Nature communications 6, 6758 

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