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RIP测序

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参考报价: 面议 型号: RIP测序
品牌: 云序生物 产地: 上海
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AI问答
可以做哪些实验,检测什么? 可以用哪些耗材和试剂?

                       RIP(RNA Immunoprecipitation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络的有力工具。这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化对结合在复合物上的RNA进行分析。RIP-Seq结合RIP技术和高通量测序,能够高通量地检测与特定蛋白结合的RNA,从而解析全转录组范围内的目标蛋白-RNA相互作用网络。
 
云序特色

全转录组覆盖:可分析与特定蛋白结合的所有转录本,包括mRNA和非编码RNA

商业化的RIP试剂盒:云序生物采用商业化RIP试剂盒,保证了RIP实验的成功率和稳定性

严格的质控:严格设置质控点,全程监控实验质量,确保客户得到优质数据

专业的生物信息分析:强大的生物信息学团队,满足客户的各类深入数据分析需求

 
数据分析

基本分析高级分析1.  数据过滤和接头序列去除CS-RIP-001.  样品间差异结合峰的识别2.  序列匹配与数据统计CS-RIP-002.  差异峰相关基因的GO与信号通路分析3.  图形化展示测序reads的基因组分布CS-RIP-003.  结合峰的motif预测鉴定4.  结合峰识别(peak calling) 5.  结合峰注释(peak annotation) 6.  结合峰相关基因的GO和信号通路分析 

 
数据展示

上图:图形化展示与蛋白结合的RNA


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1. 测序服务

转录组表观遗传组基因组真核生物原核生物miRNA测序细菌sRNA测序(h)MeDIP测序目标序列靶向测序小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA)原核生物mRNA测序RRBS测序外显子组测序lncRNA测序宏转录组测序全基因组甲基化测序人类基因组重测序环状RNA测序原核生物转录组测序ChIP测序16S rDNA测序mRNA测序原核De novo转录组测序RNA pull down宏基因组测序降解组测序 RIP测序  转录组测序 RNA甲基化测序 De novo转录组测序       

 
2. 生信服务 & PCR技术服务

生信服务实时定量PCR服务转录组表观遗传组基因组联合分析环状RNA分析DNA甲基化分析基因组分析circRNA-miRNA功能分型PCR芯片lncRNA分析ChIP测序分析微生物菌落分析LncRNA-mRNA环状RNA实时定量PCRmRNA分析 宏基因组分析LncRNA-miRNA-mRNALncRNA实时定量PCRmicroRNA分析   miRNA实时定量PCR




  


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