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小RNA是一类长度在20-30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA;
小RNA是生物体内一类重要的调控分子,调控基因的表达,参与生长发育,抵制非生物胁迫和病原菌的侵害等过程。
百迈客技术优势
高通量,低成本。
高准确性:读长覆盖小RNA全序列,产生的定量数据与实时定量PCR结果具有高度的一致性。 数字化信号:能够直接从单核苷酸水平研究小分子RNA,利于区分相同家族以及序列极为相似的不同小分子RNA。 通用的平台:可进行目标物种的小RNA序列测定,不需要前体序列信息或是二级结构信息。 丰富的信息学分析:可获得物种全基因组水平的miRNA图谱,实现新miRNA分子的挖掘、靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、miRNAs聚类和表达谱分析。
生物信息学内容
基础分析:
原始数据去杂,聚类得到小RNA的单拷贝序列库,绘制小RNA长度分布图;
与参考基因组比对,绘制小RNA的全基因组分布图;
分级注释:
与Rfam库比对,注释ncRNA(如rRNA、tRNA、snoRNA、snRNA);
与miRBase库比对,注释已知的miRNA;
与RepBase库比对,注释重复序列;
与Exon/Intron比对,鉴定mRNA降解片段;
结构与功能分析:
预测新的miRNA,预测其二级结构图;
miRNA核酸偏好性分析;
miRNA靶基因预测,靶基因功能注释;
样品间miRNA的差异表达分析;
小RNA测序(miRNA图谱 小RNA差异表达)信息由北京百迈客生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于小RNA测序(miRNA图谱 小RNA差异表达)报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途