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简介
表达谱测序 基因转录水平的研究是功能基因组学和医学研究的基础。数字基因表达谱(Digital Gene Expression Tag Profiling, DGE)利用新一代高通量测序技术和高性能计算分析技术,通过全面、经济、快速地检测某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况。数字基因表达谱已被广泛应用于基础科学研究和药物研发等领域。
应用领域
基因表达精确定量
基因表达网络构建
疾病分类研究
分析内容
1. 标准信息分析
a)对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 tags 的处理
b)测序评估(数据比对统计,测序饱和度分析,Clean tag拷贝数分布统计,Clean tag比对统计,参考基因统计)
c)基因表达注释
d)差异表达基因分析(差异表达基因筛选,实验重复性分析)
e)反义链的转录分析
f)新转录本预测(需要参考基因组序列)
g)差异基因表达模式聚类分析
h)GO功能富集分析
i)Pathway显著性富集分析 j)蛋白互作网络分析(需要蛋白互作数据库中包含该物种的注释信息)
备注:部分分析需要合作老师提供详细的参考基因组/基因数据库 2. 高级信息分析 根据客户特殊要求进行个性化分析,协商确定分析内容。
样品要求
样品类型:去除蛋白并进行DNase处理后的完整RNA
样品需求:总RNA≥4 μg ,浓度≥80 ng/μl;
样品纯度:动物样本,RIN ≥ 7.0;植物样本,RIN ≥ 6.5; 28S:18S ≥1.0。
项目运转周期
标准流程的运转周期为30个工作日
表达谱测序信息由广州基迪奥生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于表达谱测序报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途