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LncRNA芯片服务

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    长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA) 指的是长度在200-100000 nt之间的RNA分子,它们不编码蛋白,但参与细胞内多种过程调控。人们对lncRNA的认识还处在初级阶段,lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能。然而,近年来的研究表明,lncRNA参与了X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程,与人类疾病的发生、发展和防治都有着密切的关系。lncRNA的种类远远超过编码RNA,哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是lncRNA(相应的蛋白编码RNA的比例是1%-5%)。lncRNA已经成为非编码RNA研究领域的一个热点。
    lncRNA研究的重要一步是发现与特定疾病相关的lncRNA。传统的lncRNA筛选方法(SELEX等)效率低下,假阳性率高。而基因芯片具有覆盖全面、高效、准确的特点,因此用基因芯片来筛选lncRNA是一种准确快捷的方法。
 
lncRNA芯片产品
 

 
Human
小鼠
Mouse
大鼠
Rat
拟南芥
Arabidopsis
格式 4×180K 4×180K 8×60K 4×180K
lncRNA
数目
78243条 51302条 9984条 30105条
mRNA
数目
32776条 39430条 30367条 43603条
lncRNA
数据库
NONCODE.V4, Gencode v18, Ensembl Release 73, Refseq-release  62, fRNAdb.v3.4, lncRNAdb, UCSC lincRNAs Transcripts, UCSC lincRNAs Transcripts, Broad Institute, Human Body Map lincRNAs and TUCP catalog, Ultra- conserved region encoding LncRNAs (UCR) NONCODE v3, Ensembl. Release.70, Refseq-release 62, lncRNAdb, ncrna.org State Key Lab of Space Medicine Fundamentals and Applications, Ensembl.  Release.73, Refseq-release 62, Ncrna.org, Lncrnadb TAIR10, Plncdb, Refseq-release 62, Unigene build 74, Ncrna.org, Lncrnadb
mRNA
数据库
RefSeq Build 50, Ensemble Release 52, Unigene Build 216, GenBank (April 2009) RefSeq Build 37, Ensembl Release 55, Unigene Build 176, GenBank (April  2009), RIKEN 3 RefSeq Build 36.2, Ensembl Release 55, Unigene Build 177, GenBank (January 2009) RefSeq (Release 30) Jul 2008, UniGene (Build 67) May 2008, TAIR 8  cdna, Apr 2008, TIGR (Release 13) Jun 2006, TIGR Plant Transcript  Assemblies (Release 2) Jun 2006,ATHI, Jan 2004

 
技术特点:
1)目前市面上探针密度zei高的lncRNA芯片产品;
2)芯片采用Agilent eArray平台设计,使用Agilent SurePrint技术合成,技术重复性高于99%;
3)覆盖主流数据库所有lncRNA,可同时检测lncRNA和mRNA,并挖掘两者之间的关联;
4)检出率高:随机引物扩增方式,可同时扩增带Ploy-A和不带Poly-A的lncRNA,确保更多的   lncRNA被检测出来;
5)提供完整lncRNA芯片数据分析解决方案。 

LncRNA芯片服务信息由上海泉脉生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于LncRNA芯片服务报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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