DCAM-04 ：样本组间的甲基化趋势差异分析
 

实验组（或病例组）与对照组之间的差异化甲基化趋势分析将采用wilcox检验对每一甲基化位点的探针进行检验。对于多重假设检验的矫正，我们将分别采用多种校验算法，包括q-value， 配合beta-value, M -value的差值（实验组-对照组）通过排序和设定不同统计学显著性的筛选阈值的策略得到显著的待定差异化甲基化位点。原则上，我们选取p<=1E-2 作为差异甲基化位点的阈值，同时也会参考其他检验指标；原理是选择低p值保证高度可信的差异化位点。
 
另外，通过分位数-分位数图（简称Q-Q plot），我们也可以针对来自基因特异性甲基化模式-样本表型的关联分析得到的p-value（Observed -log(p-value)）与原假设计算得到的关联性期望p-value（Expected -log(p-value)）进行对比，从对比分布图上我们可直接得到与表型相关的特异甲基化基因的存在性。
 
 
 

图-1 观测与期望p-value的分位数-分位数图（简称Q-Q plot）

 
 
图-2 差异甲基化位点基因统计结果表
 

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