App Pro-05 蛋白组与转录组关联研究

蛋白质是生命功能的执行者，其含量的变化在生物体的生长、环境应激、疾病发生发展等过程中发挥着重要的作用。且从DNA、mRNA到蛋白质的过程中涉及到一整套精细的表达调控机制，如转录调控、转录后调控、翻译调控、翻译后调控等。因此，要全面探究生物体疾病机理、环境应激、生长发育机制等，精细描绘关键基因的表达模式，同步检测mRNA和蛋白质的表达量并进行联合分析已成为当前研究的必然趋势 
 

技术特点

实现mRNA和蛋白质的互补和整合，对生物体特定状态下的应激机理进行全方位分析。

通过分析同一基因转录水平和翻译水平的变化，挖掘关键基因表达调控机制，全面阐释生物基因表达 调控机制。

针对蛋白数据库不全的物种，利用转录组数据看构建的蛋白质库，可提高蛋白鉴定数目与质量。

适用于关联分析的数据类型

蛋白层面：iTRAQ、label-free、2D gel等

转录层面：RNA-Seq（denovo）、RNA-Seq（Reference）、DGE、Microarray等

信息分析内容

蛋白组与转录组定性关联分析

蛋白组与转录组定量关联分析

蛋白和mRNA表达趋势相同基因Pathway分析；

蛋白和mRNA表达趋势相反基因Pathway分析；

蛋白无变化，mRNA差异表达基因Pathway分析；

mRNA无变化，蛋白差异表达基因Pathway分析。

蛋白组与转录组表达模式聚类分析

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BioGenius具有蛋白质组数据丰富的分析处理经验。分析内容涉及：原始数据蛋白鉴定分析，蛋白修饰分析，蛋白质结构域分析，蛋白质相互作用分析，蛋白质结构建模分析，采用分子动力学模型预测蛋白-蛋白对接与蛋白-配体对接及其结合位点等。

蛋白质组是对蛋白质特别是其结构和功能的大规模研究。蛋白质组学比基因组学要复杂得多。基因组是相当稳定的实体，而蛋白质组通过与基因组的相互作用而不断发生着改变。一个生命体在其机体的不同部分以及生命周期的不同阶段，其蛋白表达可能存在巨大的差异。

常用的定量蛋白组学技术有：iTRAQ技术，LC-MS/MS技术等。

 

质谱平台

更多详情：http://www.biogenius.cn/htm/solution/proteomics/174.html

 

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