de novo测序也叫从头测序，不需要任何基因序列信息即可对某个物种进行测序。用生物信息学的分析方法对测读序列进行拼接、组装，从而获得该物种的基因组序列图谱。随着新一代测序技术的飞速发展，大大降低了基因组测序的成本和时间，为研究新物种全基因组序列提供了一个崭新的研究平台。

采用Illumina第二代高通量测序平台和PacBio第三代测序结合的方法，对未知物种的个体进行基因组测序，Illumina能产生海量的数据，可为动植物基因组组装提供高覆盖度的数据, PacBio第三代测序平台能产生非常长的读长，能跨越基因组中高重复、高杂合等复杂区域,从而能得到非常好的基因组组装结果。从基因组水平上对物种的生长、发育、进化、起源等重大问题进行研究，将加深我们对物种的认识，在发掘重要的功能基因、培育优良新品种，加速分子育种进程及相关物种的各种研究提供可靠的基础。

技术路线：

数据分析：

1、 基因组组装

2、 基因组注释

   ·   重复序列分析与注释；

   ·   基因预测；

   ·   基因功能注释；

   ·    ncRNA注释。

3、 动植物比较基因组学与进化分析

   ·   基因家族分析；

   ·   物种系统发育树构建；

   ·   基因组共线性分析；

   ·   全基因组复制分析。

 4、基因组数据库网站的建立

参考文献：

1、Kim,et al.Genome sequence of the hot pepper provides insights into the evolution of pungency in Capsicum species. Nat Genet. 2014: 10.1038

2、Wang X,et al.The locust genome provides insight into swarm formation and long-distance flight.Nat Commun.2014;5:2957.

3、venkatesh B,et al.Elephant shark genome provides unique insights into gnathostome evolution.Nature. 2014;505(7482)

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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途