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基因组DNA混池重测序挖掘优良性状基因

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AI问答
可以做哪些实验,检测什么? 可以用哪些耗材和试剂?

 针对已经基因组物种,通过群体内pooling建库的方法,进行全基因组重测序(20X以上/群体),采用生物信息学方法全基因组范围内扫描变异位点,检测性状相关的基因区域及其功能基因,可大大加速重要分子标记的发现,进而为后续分子育种提供可靠依据。

技术路线:

适用范围:

基因组已知的物种,具有明显性状差异的群体,每个群体不少于10个个体。

产品优势:

目标明确挖掘重要性状关键功能基因;

成本降低群体内pooling测序;

利用率高可利用已发表物种的数据库信息;

高效精准完成高密度的变异检测(SNP);

精确定位缩小定位群体候选基因范围。

 

参考文献:

1Erik A, Abhirami R, Maja A, et al. The genomic signature of dog domestication reveals adaptation to a starch-rich diet. Nature, 2013, 495, 360–364.
2
Rubin CJ, Zody MC, Eriksson J, et al. Whole-genome resequencing reveals loci under selection during chicken domestication. Nature, 2010, 464: 587-591.

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