脂质组学

脂质组学（lipidomics）作为最重要的代谢组学分支之一，是最近几年研究的热点。脂质是生物体内重要的一大类化合物，它们在结构上有很大的差别，但具有相同的特点，即：不溶于水、而溶于氯仿和丙-酮等非极性有极溶剂中。脂质主要可分为8类，脂肪酸类（fatty acyls）、甘油脂类（glycerolipds）、甘油磷脂类（glycerophospholipids）、鞘脂类（sphingolipdis）、固醇脂类（sterol lipids）、孕烯醇酮脂类（prenolipids）、糖脂类（saccharolipids）、多聚乙烯类（polyketides）。
脂质结构的多样性赋予了脂质多种重要的生物功能．脂质不仅参与调节多种生命活动过程，包括能量转换、物质运输、信息识别与传递、细胞发育和分化，以及细胞凋亡，而且脂质的异常代谢还与多种疾病发生发展密切相关，如动脉硬化症、糖尿病、肥胖症、阿尔茨海默病（Alzheimer disease，AD）以及肿瘤等。

研究流程：


应用范围：
临床诊断：生物标志物，疾病机理机制等；
生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；
微生物领域：耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；
海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等；
食品营养：食品储藏，品质鉴定，功能性食品开发等；
生物能源：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等；
农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等。

帕诺米克优势：
使用LipidSearch数据库，收录超过8大类、300种亚类、170万种脂质分子的MS2&MS3数据库；
14种同位素标记脂质，可同时半定量上千种脂质；
样本的多样性：血液、粪便、组织、线粒体、外泌体等等。

样本要求：
动物组织 ≥ 0.2g
血清、血浆 ≥ 0.3ml
尿液 ≥ 0.25ml
唾液 ≥ 1ml
粪便 ≥ 0.3g
细胞 ≥ 10⁷个
植物组织 ≥ 2g
微生物 ≥ 0.12g
土壤 ≥ 10g
样本的保存：液氮 或 -80℃保存
样品运输：干冰运输

生物学重复：
为排除个体差异，建议对于临床样品，生物学重复 ≥ 30；对于培养的细胞、微生物、动物模型及植物，生物学重复 ≥ 8。

分析内容：


案例分享：
【项目文章】CircACC1调节AMPK复合物在代谢压力下的组装和激活
发表时间：2019年
期刊：Cell Metabolism
影响因子：22.415
     细胞代谢受其所在微环境的影响。AMPK（AMP活化蛋白激酶）是重要的细胞能量感受器，在细胞能量不足时被激活，进而影响细胞的脂肪酸氧化、糖酵解、脂降解等代谢活动。代谢异常是肿瘤细胞的重要特征之一。由于AMPK在细胞代谢中的关键地位，活性受到严格调控，被视为肿瘤治疗的潜在靶点。环状RNA是非编码RNA领域最新的研究热点，这类特殊的非编码RNA具有组织特异性，在多种疾病生理中发挥着重要的调控作用，但环状RNA是否参与AMPK的调控尚未清楚。


     图1 研究路线


     图2 参与脂质代谢的环状RNA circACC1的鉴定

参考文献：
Li et al., CircACC1 Regulates Assembly and Activation of AMPK Complex under Metabolic Stress. Cell Metabolism. 2019 Jul 2;30(1):157-173.e7.

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