16S/ITS/18S扩增子测序

发布时间：2022年07月

· 产品定义

扩增子测序是指对16S rDNA/18S rDNA/ITS/功能基因等特定区段PCR产物进行高通量测序，突破传统微生物不可培养的缺点，获得环境样本中的微生物群落结构、进化关系以及微生物与环境相关性等信息。

· 技术路线

· 技术优势

1. 样本处理经验丰富：粪便、内容物、土壤、水体、淤泥、发酵物等样本

2. 测序灵活：多种测序策略，可满足16S/18S/ITS不同高变区域的研究需求

3. 平台优、数据质量高：基于优质的Illumina NovaSeq测序平台，数据质量高

4. 分析内容丰富：可选择与各种代谢组学产品进行组学联合分析

· 数据分析

· 部分数据分析结果展示

· 推荐组合产品

1. 16S+代谢组：环境/宿主表型变化的微生物互作研究

2. 16S+宏基因组：环境/宿主微生物群落结构和功能潜能研究

3. 16S+代谢组+转录组：宿主和微生物的协调响应机制研究

· 推荐应用领域

1. 生理/病理机制：肠道/口腔/皮肤/生殖等微生物群落的影响机制

2. 植物共生胁迫：土壤根际微生物与植物的互作机制

3. 精准医学：肠道微生物及多组学疾病标志物

4. 药物研发：基于肠道微生物作用机制的药物研发

5. 环境能源：环境、土壤、水体微生物群落研究

· 送样建议(特殊样本可直接咨询021-5466-5263/400-066-6761)

· 项目案例

文献名称：Depression and anxiety in patients with active ulcerative colitis: crosstalk of gut microbiota, metabolomics and proteomics

发表期刊：《Gut Microbes》（IF=10.245）

合作单位：江苏省中医院

文章摘要：溃疡性结肠炎（UC）患者通常并发精神障碍，肠道微生物群失衡和代谢紊乱被认为在UC或精神障碍中起重要作用，然而其多组学特征仍然知之甚少。在这项前瞻性观察性研究中纳入240名中国人群，使用16S rRNA测序、液相色谱/质谱分析了人群的肠道菌群、血清代谢组和蛋白质组；并研究了候选代谢物对结肠炎小鼠抑郁样行为的预防作用。总体上，58%的活动性UC患者患有抑郁症，50%患有焦虑症。与无抑郁/焦虑的UC患者相比，有抑郁/焦虑的UC患者的粪便微生物群落丰富度和多样性较低，乳酸杆菌属、月形单胞菌属、链球菌属和肠球菌属较多，而普氏菌属_9和毛螺菌属较少。大多数代谢物（例如，甘鹅去氧胆酸盐）在血清中增加，而少数代谢物（包括2′-脱氧-D-核糖和L-哌啶酸）减少，伴随着免疫球蛋白的普遍减少，并且这些变化的细菌、代谢物和蛋白高度相关。预防性给药2′-脱氧-D-核糖和L-哌啶酸可显著降低结肠炎小鼠的抑郁样行为，并减轻其结肠、血液和大脑中的炎性细胞因子水平。本研究确定了一个与活动性UC患者抑郁和焦虑相关的综合多组学网络，它由一组特定的肠道微生物群、代谢物和蛋白质组成，它们是UC和抑郁/焦虑患者临床干预的潜在目标。

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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途