绝对定量转录组测序（DigitalRNA-seq）

绝对定量转录组测序在文库扩增之前为每一条逆转录的cDNA片段加上唯一的身份标签（Unique Identifier，UMI或UID），也称为数字标签。数字标签会伴随片段扩增、测序、分析的全过程。同一个片段经过PCR扩增出来的产物均带有相同的数字标签，测序完成后利用UMI追溯每一个片段的来源，将相同来源的片段（具有相同的序列和UMI）进行合并，就能准确去除PCR扩增重复，一比一准确还原样本扩增前的原始状态。在此过程中，PCR扩增和测序错误同样可以被纠正：扩增和测序的错误会使得相同UMI标签对应多个不同的序列，那么只需比较这些序列的相似性，即可纠正这些错误。


绝对定量转录组利用UMI技术排除PCR扩增偏好和错误影响，可对表达量作准确的定量分析，与qPCR检测结果高度一致。绝对定量转录组测序为您带来全新的体验。
 

建库起始量从1ug降低到100ng，更适合稀少珍贵的样本。

准确筛选差异表达基因，既不错选也不漏掉。

避免低丰度转录本丢失，构建可靠的共表达网络。

准确检测寄生菌或内生菌的转录表达情况。对于难以分离的寄生菌，测序数据中有大量的宿主基因的转录本，通常需加大测序深度才能检测到寄生菌的转录本，而加大测序深度无疑又增加错误的几率、导致准确度下降。UID技术可去重并纠错，排除加大测序深度造成的影响，并对寄生菌的转录组准确定量。

在分析cSNP位点时，由于UID技术具有纠错功能，可排除假阳性位点，准确锁定真实的cSNP位点。

UID技术的纠错功能同样帮助确定可变剪接位点、RNA编辑，有助于可变剪接、RNA编辑的准确分析。

                    建库方法                                               技术流程

       KC-DigitalRNA测序结果通过qPCR验证                     建库起始量仅需100ng


       提高clean data中unique reads的比例                     良好的样本重复性
    

 

低丰度转录本的检测

某菌（植物的寄生菌，无法与植物组织分离）的转录组测序，将植物、某菌的参考基因组进行混合，然后比对，继而提取仅比对到该菌参考基因组上的reads，占比2.53%，大部分read（比对到植物参考基因组）未比对到该菌参考基因组。



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武汉康测科技有限公司是由加州大学圣地亚哥分校（UCSD）、武汉大学、华中农业大学博士团队创建的高新技术企业。截至2017年底，团队核心成员已在Nature、Cell、Molecular Cell、Nat. Struct. Mol. Biol.、Proc Natl Acad Sci USA、Cell Reports等国际顶级期刊发表文章十余篇。公司秉承技术创新、服务至上的核心理念，与多所985/211院校、中国科学院的实验室建立了长期合作关系。
 

公司研发团队于2017年成功开发出绝对定量转录组（KC-DigitalRNA）、免疫组库（KC-IRQuant）、16S rDNA绝对定量、ctDNA检测（KC-SMP）等4项建库技术，并成功申请发明专利和配套数据分析系统的软件著作权。成为中国首家UID（UMI）绝对定量高通量测序服务平台，为广大科研工作者提供转录组（mRNA、lncRNA）/TCR/BCR/ctDNA/肠道微生物多样性等多种绝对定量测序服务。
 

作为国内核酸-蛋白互作研究服务的领跑者，公司已完成1000多项ChIP-seq、RIP-seq、CLIP-seq实验及测序分析服务，包括动物（人、小鼠、大鼠、羊、鸡、斑马鱼等）、植物（水稻、拟南芥、小麦、二穗短柄草、马铃薯、番茄、苹果等）、微生物（大肠杆菌、禾谷镰刀菌等）近50余种物种的CHIP-seq和RIP-seq，其中组蛋白ChIP-seq成功率接近100%，转录因子ChIP-seq成功率超过95%，RIP-seq、CLIP-seq成功率接近95%。
 

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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途