简介：

染色质分为常染色质和异染色质，而常染色质处于松散的开放状态，允许反式作用因子结合顺式调控元件，进而调控基因表达。ATAC-seq 利用tn5 酶切割并捕获染色质开放区域，结合高通量测序和生信分析，可以系统研究全基因组范围内染色质开放区域，是表观调控研究的新方向。

项目流程：
 

康测科技优势：
 

国内核酸-蛋白互作研究服务领跑者，由加州大学圣地亚哥分校（UCSD）、武汉大学、华中农业大学博士后组建的团队，成员已在Nature、Cell、Melecular Cell、Nat.Struct.Mol.Biol等知名期刊发表文章十余篇；

实验流程精简，交付周期更短，性价比更高；

技术重复性好；

全面的多组学关联分析。

部分结果展示：
 

ATAC-seq的应用
 

案例解析

ATAC-seq、ChIP-seq、 RNA-seq关联分析揭示转录因子FOXA1的临床意义
FOXA1是驱动型转录因子(pioneer TF)，其突变能引起一定类别的前列腺癌。 作者通过对3086例原发性和转移性前列腺癌组织样本的调查，发现FOXA1 基因在前列腺癌中存在不同类型的突变,并且通过细胞模型和动物模型证明这些FOXA1基因突变对前列腺癌的发生或转移有促进作用。最后作者通过ATAC-seq、ChIP-seq、 RNA-seq等 技术研究FOXA1不同突变类型的作用机制。发现FoxA1竞争性结合AR调控的基因，并且不同的突变类型造成的结合位点不同，引起的染色质开放区域也不同,导致相关基因表达具有突变特异性。

参考文献: Adams EJ et al., FOXA1 mutations alter pioneering activity, differentiation and prostate cancer phenotypes. Nature, 2019, 571(7765):408-412
具体文章解读可以关注康测科技微信公众号，点击"Nature: 如何选择具有临床意义的基因并揭示其功能”。
 

武汉康测科技有限公司是由加州大学圣地亚哥分校（UCSD）、武汉大学、华中农业大学博士团队创建的高新技术企业。截至2017年底，团队核心成员已在Nature、Cell、Molecular Cell、Nat. Struct. Mol. Biol.、Proc Natl Acad Sci USA、Cell Reports等国际顶级期刊发表文章十余篇。公司秉承技术创新、服务至上的核心理念，与多所985/211院校、中国科学院的实验室建立了长期合作关系。
公司研发团队于2017年成功开发出绝对定量转录组（KC-DigitalRNA）、免疫组库（KC-IRQuant）、16S rDNA绝对定量、ctDNA检测（KC-SMP）等4项建库技术，并成功申请发明专利和配套数据分析系统的软件著作权。成为中国首家UID（UMI）绝对定量高通量测序服务平台，为广大科研工作者提供转录组（mRNA、lncRNA）/TCR/BCR/ctDNA/肠道微生物多样性等多种绝对定量测序服务。

染色质开放性测序--ATAC-seq信息由武汉康测科技有限公司为您提供，如您想了解更多关于染色质开放性测序--ATAC-seq报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。

注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途