一、产品简介
10x Genomics的Chromium Controller是基于微流控技术的单细胞文库制备系统，可以同时获 得3000-80000以上的单细胞，制备文库和Illumina平台兼容，通过测序实现对高通量单细胞数据 进行细胞群体的分类以及细胞群体间基因表达的差异分析。10x Genomics单细胞表达分析可应用 的细胞类型众多，如肿瘤细胞、免疫细胞、干细胞、神经细胞、生殖细胞、胚胎细胞等。是研究肿瘤异质性，免疫细胞群体和胚胎发育的优秀方法。

二、实验流程
 

（一）文库制备

10x scATAC-seq基于GemCode微流体平台，首先利用转座酶混合液孵育细胞核悬液，转座酶进入细胞核，优先在切割开放染色质区域使DNA片段化，并在DNA片段的末端添加测序引物；其次，带有标签（Barcode）的凝胶珠（GelBeads）和单个细胞核包裹在油滴中，形成GEMs；随后凝胶珠溶解，细胞核裂解释放DNA片段，并在片段末端加上标签；GEMs破裂后，回收带有标签的DNA，构建文库；最后，利用Illumina测序平台对文库进行高通量测序。

文库制备流程图示
 

（二）分析流程

三、单细胞ATAC测序性能分析

 1.单细胞分辨率下的表观基因组研究                

2.低线粒体reads数（例如，GM12878细胞<2%）                

3.每个通道可捕获500-10000个核（每个芯片8个通道）                

4.65%的核捕获率              

5.细胞系、原代细胞、新鲜和冷冻保存的样品均兼容          

6.每个细胞的染色质开放状态分析和可视化分析

四、部分结果展示

A:Cell Ranger  数据统计

B: 插入片段长度                                                               C: Reads 在TSS上下游的分布  



D: 细胞聚类分析                E: 指定基因reads分布图       F: TF_motif富集聚类热图     G: TF和基因互作网络图

单细胞ATAC测序信息由武汉康测科技有限公司为您提供，如您想了解更多关于单细胞ATAC测序报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。

注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途