全基因组甲基化测序-全基因组甲基化测序有rna污染影响大吗

全基因组甲基化图谱（DNA methylation profiling）及单样品高低甲基化位点在基因组不同区域的分布：全基因组甲基化测序可全面、精确地检测全基因组DNA甲基化状态，为更深入的表观遗传调控分析奠定基础。在全基因组甲基化图谱的基础上，对基因组不同染色体、不同基因区域、不同序列环境、不同基因功能元件如启动子、外显子、内含子、UTR区的胞嘧啶甲基化状态进行分析，有助于从多个角度研究基因的功能及调控。

全基因组甲基化测序技术原理

     WGBS（Whole-genome bisulfite sequencing）被视为甲基化测序的“金标准”。其原理是用Bisulfite处理，将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U，进行PCR扩增后变成T，与原本具有甲基化修饰的C碱基区分开来，再结合高通量测序技术，与参考序列比对，即可判断CpG/CHG/CHH位点是否发生甲基化，特别适用于绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。

中康博技术优势

● 优秀的建库质量：十二年文库技术积淀，具有丰富的样品处理经验和建库经验
● 完善的质控过程：可以提供整套质控分析，确保数据准确性
● 丰富的基础分析内容：从各个层面综合解析WGBS数据
● 更个性化的生物信息分析服务：专业的生物信息分析团队，熟悉各种分析算法和软件；与客户充分互动，提供更多个性化分析 思路和分析方案
● 易读性强的数据报告：提供全面的数据及图形内容，同时撰写详细的软件使用手册，帮助客户更好的进行数据查看

推荐测序模式

● 测序平台：Hiseq X Ten
● 测序类型：PE50
● 测序深度：30 X （或 50 X）

全基因组甲基化研究思路

    全基因组甲基化测序不但可使研究者在基因组规模洞察不同生物之间在DNA 甲基化水平和模式上的差异, 也可用于研究同一物种多个样品间的差异性甲基化区域（differentially methylated regions DMRs）。同时，基因组的甲基化状态具有一定的时空特异性。对某一物种，不同的环境、不同的发育阶段、不同类型的样品（细胞、组织、个体）所反映的甲基化状态可能是不同的，存在着差异性甲基化区域。其中有些是与基因调控有关的功能区域。鉴定、分析这些区域及其所在的基因或CpG岛，对发育和肿瘤等生命过程研究有一定意义。

全基因组甲基化测序项目流程

 
全基因组甲基化测序分析流程

 

全基因组甲基化测序样品要求（基因组DNA）

   样品纯度：OD 260/280值应在1.8～2.0 之间； RNA 应去除干净；
   样品浓度：最低浓度不低于50ng/µl；
   样品总量：每个样品总量不少于15µg；
   样品溶剂：应溶解在H20或TE (pH 8.0)中；
   样品运输：DNA低温运输（-20℃）；在运输过程中将管口密封好，以防出现污染。

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