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一种无酚/无氯仿组织研磨从热带木本植物中提取核酸的方法,可用于基因表达和测序

发布时间: 2019-12-19 11:59 来源: 培安有限公司
领域: 细胞生物学,生理生态,分子生物学,基因/基因组/测序,多组学/蛋白质组/代谢组/脂质组
样品:牛油果树、夏威夷果树、芒果树的茎、叶、根、花、腋芽组织,咖啡树、桉树项目:RNA、DNA
参考:Plant Methods

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一种无酚/无氯仿组织研磨从热带木本植物中提取核酸的方法,可用于基因表达和测序

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    木本热带植物中含有大量复杂的有机化合物,这些有机化合物会抑制提取RNA或DNA所需的化学程序,从而不利于后续研究及应用,如RNA测序和基因表达分析。为了克服这个问题,研究人员必须使用CTAB / PVP缓冲液的提取方案,而不能使用市售的DNA / RNA提取试剂盒。但是,这种提取方式耗时长、需使用有毒化学品(例如苯酚和氯仿),并且一次只能处理少量样品。为了克服这些问题,我们开发了一种基于CTAB / PVP的新方法,用于RNA或DNA提取,去掉了传统方法中的苯酚/氯仿步骤。此外,该方法同样适用于96孔深孔板,使用SPEX高通量组织研磨仪,一次研磨6块深孔板,同时处理576个样品,大大加快了处理速度。

 

    我们的新方法,能够从夏威夷果、牛油果和芒果组织中,成功提取RNA,这些组织使用传统方法很难提取到RNA。而后我们还验证了,该方法提取的RNA成功地合成cDNA,以进行实时定量PCR并生成高质量的RNA-Seq库。该方法经轻微改动后,可用于从不同的热带和亚热带树种中快速提取DNA。

 

    这种方法可以更安全、更快速地从困难样品中提取DNA和RNA,从而为将来在热带树木上的研究提供了便利。

SPEX高通量组织研磨仪

超高通量:一次可处理576个样品或16个50mL样品瓶

超高效率:垂直振荡专利技术,1-2min完成困难样品研磨、均质

高均一性:批量处理样品,程序化处理机制,均一性、重复性更好

更人性化:可调角度彩色触摸显示屏,可编辑、调用、存储500种方法

适用性广:程序可调,更多研磨瓶、研磨介质可供选择,完美契合不同样品研磨、混匀需求

安全可靠:双重门锁,研磨过程更安全;设置保密程序,限制查看特定方法

低温研磨:专业Kryo-Tech低温组件及可调循环程序,维持研磨全过程低温,适合温度敏感型样品

 

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