Illumina Hiseq 2500/1500 测序仪

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illumina基因/DNA测序仪, 强大高效，适合大规模基因组学 HiSeq 2500系统是一台强大的高通量测序系统。利用Illumina成熟的边合成边测序......

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高产出运行模式*

试剂盒参数
HiSeq SBS V4
读长	1 × 36 bp	2 × 50 bp	2 × 100 bp	2 × 125 bp
双流动槽	128–144 Gb	360–400 Gb	720–800 Gb	900 Gb–1 Tb
单流动槽	64–72 Gb	180–200 Gb	360–400 Gb	450–500 Gb
双流动槽运行时间	29小时	2.5天	5天	6天
TruSeq SBS V3
读长	1 × 36 bp	2 × 50 bp	2 × 100 bp	2 × 125 bp
双流动槽	95–105 Gb	270–300 Gb	540–600 Gb	N/A
单流动槽	47–52 Gb	135–150 Gb	270–300 Gb	N/A
双流动槽运行时间	2天	5.5天	11天	N/A

附加的试剂盒参数
HiSeq SBS V4
流动槽类型	双流动槽	单流动槽
通过过滤的read（每个流动槽有8个通道）	高达40亿条单端read，或80亿条双端reads	高达20亿条单端read，或40亿条双端reads
质量	在2 x 50 bp时，超过85%的碱基高于Q30 在2 x 100 bp时，超过80%的碱基高于Q30 在2 x 125 bp时，超过80%的碱基高于Q30
TruSeq SBS V3
流动槽类型	双流动槽	单流动槽
通过过滤的read（每个流动槽有8个通道）	高达30亿条单端read，或60亿条双端reads	高达15亿条单端read，或30亿条双端reads
质量	在2 x 50 bp时，超过85%的碱基高于Q30 在2 x 100 bp时，超过80%的碱基高于Q30

*安装参数是根据在所支持的簇密度下运行Illumina PhiX对照文库所得（利用TruSeq v3试剂盒，通过过滤的簇密度是610–678 K/mm2，利用HiSeq v4，通过过滤的簇密度是870–930 K/mm2。高产出模式的运行时间只对应于测序本身。根据样本质量、簇密度及其他实验因素的不同，性能可能会有所差异。

快速运行模式†

试剂盒参数
HiSeq Rapid SBS Kit V2
读长	1 × 36 bp	2 × 50 bp	2 × 100 bp	2 × 150 bp	2 × 250 bp
双流动槽	18–22 Gb	50–60 Gb	100–120 Gb	150–180 Gb	250–300 Gb
单流动槽	9–11 Gb	25–30 Gb	50–60 Gb	75–90 Gb	125–150 Gb
双流动槽运行时间	7小时	16小时	27小时	40小时	60小时

附加的试剂盒参数
HiSeq Rapid SBS Kit V2
流动槽类型	双流动槽	单流动槽
通过过滤的read（每个流动槽有2个通道）	高达6亿条单端read，或12亿条双端read	高达3亿条单端read，或6亿条双端read
质量	在2 x 50 bp时，超过85%的碱基高于Q30 在2 x 100 bp时，超过80%的碱基高于Q30 在2 x 250 bp时，超过75%的碱基高于Q30

† 安装参数是基于在所支持的簇密度下运行Illumina PhiX对照文库所得（利用HiSeq Rapid v2 Kit，通过过滤的簇密度是700–820 K/mm2。高产出模式的运行时间只对应于仪器上簇生成（1.5小时）和测序。根据样本质量、簇密度及其他实验因素的不同，性能可能有所差异。早期的HiSeq 2000仪器在升级到HiSeq 2500后，运行速度略微减慢。


	HiSeq 2500系统（高输出模式）	HiSeq 2500系统（快速运行模式）	HiSeq 3000系统	HiSeq 4000系统
运行时间	29小时–6天	7–60小时	＜1–3.5天	＜1–3.5天
zei大输出	1000 Gb	300 Gb	750 Gb	1500 Gb
每次运行获得的zei大read数	40亿	6亿	25亿	50亿
zei大读长	2 × 125 bp	2 × 250 bp	2 × 150 bp	2 × 150 bp

参考性能参数：

读长	High Output 模式*			Rapid 模式*
读长	双FC运行	单FC运行	双FC运行时间	双FC运行	单FC运行	双FC运行时间
1×36	95-105Gb	47-52Gb	2天	18-22Gb	9-11Gb	7小时
2×50	270-300Gb	135-150Gb	5.5天	50-60Gb	25-30Gb	16小时
2×100	540-600Gb	270-300Gb	11天	100-120Gb	50-60Gb	27小时
2×150	--	--	--	150-180Gb	75-90Gb	40小时
质量标准	2×50bp Q30≥85% 2×100bp Q30≥80%			2×50bp Q30≥85% 2×100bp Q30≥80% 2×150bp Q30≥75%

说明：

1、以上数据基于Illumina标准品PhiX，High Output模式使用v3测序试剂推荐上机密度为750-850k/mm2 ，PF后约为610-678k/mm2；Rapid模式推荐上机密度为750-900k/mm2，PF后约为700-820k/mm2。上机结果会根据样品质量、Cluster密度及实际实验情况有所改变。

2、Rapid模式测序运行时间包括在HiSeq上进行Cluster generation的时间（约1.5小时）及测序时间；High Output模式测序运行时间只包括测序时间，不包括Flow Cell制备时间（约为4-5小时）。

3、HiSeq2000机器出厂号码<700895的机器，Rapid 模式的运行时间约延长15小时。