BioNumerics生物信息学软件

BioNumerics是能够以生物学的各种试验数据作为输入数据，  以强大的整合数据库为中心，对生物学数据进行比较，分析，研究的系统。它是在凝胶电泳分析软件GelCompar  II的基础上整合其他功能而来的，它有以下三个重要特征：

1.数据管理：提供对指纹类型、2D胶类型、序列类型、字符类型、矩阵类型、曲线和动力学描述类型等所有生物学数据存储，提取，搜索功能，非常适合做生物实验室数据管理的核心。

2.数据分析：通过对数据进行比较筛查，分析数据之间的不同点和相似性，从而将数据进行分类，定义，和统计学分析，并可用来鉴定未知的生物体。BN分析功能的独特之处在于它可以综合不同实验方法的的结果，给用户一个可靠的结论。

3.网络共享：使用BN提供的网络共享功能，在指定的网络里，用户之间可以方便地交换共享生物数据，并能导入互联网上知名的专业数据库。

BioNumerics的功能模块(数据处理的应用模块) 共6个

1.Fingerprint types：可以处理PFGE, AFLP, RFLP, RAPD, REP-PCR, ARDRA, isoelectric focusing，DGGE, TGGE等电泳数据；气相色谱和HPLC数据；DHPLC数据； 分光光度曲线等数据。

2.Character types：可以处理生物抗性实验数据；脂肪酸甲基化脂(FAME)分析数据；生物显性阵列数据；API表型测试数据；微阵列芯片数据；Dot blots和probe sets数据；Spoligo—typing数据；生化试验数据；酶活和代谢活性数据等。

3.Sequence types：可以处理核酸(DNA或RNA)和氨基酸序列；自动测序仪(Applied Biosystems, Beckman, Amersham)得到的色谱文件；广泛的识别各种序列格式， 包括EMBL， GenBank和Fasta格式。

4.Trend data types： 处理实时荧光定量 PCR数据；代谢活性和酶活性的动力学数据；微阵列实验中的时间进程数据等和趋势相关的实验数据。

5.Matrix types：处理DNA同源性相似度的表格数据；DNA杂交数据等矩阵类型数据。

6.2D gel types：处理双向凝胶电泳试验数据；DIGE试验数据。可以将从2-D胶中鉴定到的蛋白点被直接存储在数据库中。

生物实验数据进行分析的功能模块(共4个)

Comparison and Cluster Analysis：在BioNumerics中通过把关系数据库中的各种记录之间，多种试验之间，用多种有效的聚类算法可以实现多种聚类分析。

Identification：根据生物试验数据结果来鉴定未知的生物体或物种，可构建文库。

Dimensioning techniques：评估各种聚类分析方法的可靠性的技术

Database Sharing Tools：整合的数据库共享工具。

系统需求

需要奔腾CPU, 64M 内存以上,65K图像以上,Windows98,Windows NT4.0.CD-ROM, 鼠标.

推荐显示器分辨率: 1024×768 以上

参考招标参数：

北京市通州区疾病预防控制中心购置医疗设备采购项目（二次招标）

招标编号：CEITCL-BJ10-1811020 

二、生物数据分析中文版软件：

（一）、技术参数：

*1.1、客户端版必须与国家中央服务软件（国家食品安全风险评估中心TraNetChina）相匹配，可以将基层疾控机构采集的致病微生物基因图谱数据进行数据管理、数据分析和数据网络共享。 

1.2、中文版本，可对食源性疾病数据进行比较筛查、分析研究、监测溯源。

1.3、指纹数据模块：处理电泳数据（包括凝胶电泳和毛细管电泳）、色谱数据、光谱数据等。

1.4、特征数据模块：处理特征字符数据包括抗生素敏感性实验数据、脂肪酸数据、微阵列芯片数据、酶活测试（API®, Biolog®, Vitek®）和代谢活性数据等。

1.5、树状分析和网络推理模块：能对关系数据库中的多种实验数据进行聚类分析。

1.6、ID分析模块：即利用监督式学习对数据进行分类、数据库筛选、决策网络构建和菌种鉴定等。

1.7、数据库共享工具：用户、数据库和实验室之间的数据交换与共享。

*1.8、可以收集、上报导入耐药分析结果。

*1.9、数据上报和审核插件：接入国家食源性疾病分子溯源网络（TraNetChina），各市级疾控中心或其他技术机构可与省级平台对接进行数据上报和比对分析；省级疾控中心管理员可以审核和管理全省数据，并可以将全省信息上报国家食品安全风险评估中心。

*1.10、无缝连接国家食源性疾病检测报告系统，获取国家食源性疾病监测报告系统中相关病例及标本信息。

1.11工作站： 

1.11.1 CPU：I5或以上性能

1.11.2内存≥8G，硬盘≥1T+128SSD

1.11.3 彩色液晶显示器≥20吋

1.11.4打印机：黑白激光打印机