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实时定量RT-PCR检测急性白血病患者中WT1表达

关键词: 实时 定量 rt-pcr来源: 互联网

WT1(Wilms’ tumor gene,WT1)定位于11p13,是最早发现与Wilms’肿瘤发生、发展有关的基因。 WT1主要在胚胎发生过程中表达,对泌尿生殖系统的发育起重要作用,在成人,WT1仅在肾脏、卵巢、子宫内膜、睾丸、脾脏、乳腺及正常造血祖细胞微量表达 [1]。 研究发现几乎所有的白血病原始细胞(无论系别)都持续过表达WT1,与其在极少数生理性造血干细胞(CD34 + )中短暂低表达形成鲜明对比,定性和半定量RT-PCR法在区别单个核细胞WT1是生理性还是病理性表达存在缺陷和限制,WT1作为“泛白血病标志”(panleukemic marker)在急性白血病中的表达及预后意义是一个有争论的问题[2],为进一步准确检测,我们采用实时定量RT-PCR技术检测了108例急性白血病患者骨髓中WT1的表达水平,报道如下:
对象与方法
1 研究对象 所有的白血病患者均来自苏州大学附一院及附三院血液科2002年3月~2003年10月门诊或住院治疗的患者,男62例,女46例,年龄6岁~72岁之间,中位年龄36 .5岁。白血病的诊断均经临床、血象、骨髓象及组织化学染色、免疫分型、染色体检查确诊,部份患者行融合基因检测,符合白血病MIC分型。其中AML 95例(M0 2例,M 1 20例,M 2 38 例,M 3 18例, M 4 7例, M 5 10例 ),ALL 13例。对照组23例,为同期就诊非白血病患者(过敏性紫癜,缺铁性贫血 ,免疫性血小板减少性紫癜,巨幼细胞性贫血,淋巴瘤)及健康供者CD34细胞。以WT1高表达的K562细胞作为阳性对照。
2 主要 试剂 TRIzol总RNA提取液购自Gibco BRL公司,逆转录酶M-MLV购自Promega公司,Taq DNA聚合酶购自上海申友公司。
3 骨髓单个核细胞分离:常规抽取患者骨髓液2~5ml,肝素抗凝,用淋巴细胞分离液(Ficoll分离液)分离单个核细胞,计数(5~10)×10 6 细胞加TRIzol总RNA提取液1ml,混匀后-20℃冻存(时间小于2月)用于RNA制备。
4 RNA提取及定量:采用TRIzol一步法提取骨髓单个核细胞总RNA,紫外分光光度仪测定OD 260 ,OD 280 吸光值(A),计算RNA含量。
5 cDNA链合成:逆转录反应体积为40ul,包括标本RNA 2ug,六随机引物100ng,5×逆转录buffer 5 ul, 10 mM dNTP 1.25 ul, Rnasin 25 U, 逆转录酶200 U。37℃ 45 min, 95℃ 5 min, -20℃保存备用。
6 定量阳性模板的克隆:培养K562细胞,在细胞生长的指数期收获细胞,同法提取RNA并逆转录成cDNA,Primer Premier软件设计引物(正义:5’-AGA GCG ATA ACC AC CAA CG- 3’;反义: 5’- GGC GTT TCT CAC TGG TCT CA -3’)扩增含WT1靶序的150bp的片段,纯化、测序后克隆至pMD18-T载体(上海申友公司),抽提、纯化重组质粒,测OD值,根据分子量及阿佛加德罗常数(6.023×10 23 分子数/mol)换算为分子拷贝数,按1011拷贝/ul浓度冻存于-20℃备用。GAPDH阳性模板由上海肿瘤研究所董强刚教授提供,以10 9 拷贝/ul浓度存于-20℃备用。

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