聚丙烯酰胺的特性，包括机械性能，弹性，透明度，孔径大小取决于T，C，T是两个单体(单体丙烯酰胺和N-N’-甲叉双丙烯酰胺)的总百分浓度，C是与总浓度有关的交联百分比浓度。

 T=(a+b)/m

C=b/(a+b)

（a为单体丙烯酰胺的克数，b为N-N’-甲叉双丙烯酰胺的克数，m为缓冲液终体积）

a，b的比例很关键，如果a:b 小于10，胶脆，硬

如果a:b 大于100，胶糊状。

一般有弹性，透明的胶，a:b比例应在30。一般的胶联度是随着T的增加而降低的，在5%-20%交联度的公式 C=6.5-0.3T

而T是根据分离物质的分子量大小决定，因为蛋白在不同浓度凝胶的迁移率，是随总浓度的增加而降低的。因此在分离不同分子量的混合物时，要选适宜浓度的凝胶。