对控基因是控制副节形成的基因，由于这种基因发生突变，可引起每隔一节缺一节，因此之故称为对控基因。对控基因包括fushi、tarazu、hairy、even-skipped基因等，它们在细胞副节的条纹中表达，编码产物是转录因子。每一个对控基因在7个副节中表达， 表达的副节可以是偶数，也可以是奇数副节，表达后产生7条表达条纹。各种不同的研究结果表明条纹的出现为一渐变过程，条纹的最初边缘模糊，随后才逐渐明显。每一条纹中表达的基因分别受不同的间隔基因和母体基因编码的转录因子的控制，对控基因对不同浓度和不同组合间隔基因转录因子的反应，确定了每一条带纹的定位。