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高通量高质量的全血基因组DNA提取(可达芯片级)

关键词: 全血 基因组DNA提取 高通量 高质量来源: 互联网

从全血中提取DNA是一项古老又基本的分子生物学的工作,根据不同的下游的实验和分析,历史上使用方法种类非常多,传统酚氯仿抽提法,高盐盐析法,硅胶模离心柱吸附法,磁珠法,等等。各种方法都有自己的优点和缺点。随着时代的发展,尤其是近年来,各种高通量的下游应用,比如血库HLA分型,芯片制作,遗传分析,市场需要一种低成本,速度快,操作简单,高通量的全血DNA提取方法。 在这个背景下,硅胶膜离心吸附柱型的产品成了很多客户的首选。

原因分析如下:

1. 随着技术的进步,尤其是PCR/RealTime PCR扩增的技术进步,很多样品的需求量大大减少,几百个纳克到几个微克足够,而最常见的离心柱型小量提取,正好可以提取几个微克到十几微克的样品。完全可以满足下游试验的需要。

2. 离心柱操作不使用苯酚,氯仿有毒害物质。方便快捷,裂解后配合蛋白酶K消化,过柱子,漂洗,洗脱,几个简单步骤就可以完成全部过程。适合于标准化高通量操作,对操作技巧要求低,即使初学者提取也可以得到稳定的结果。

3. 联合的蛋白酶K消化,和漂洗,可以确保了高纯度的可能性。是目前所有方法中,纯度最高的一种全血DNA提取方法。

4. 国外的公司为了追求高利润,将该类产品价格定位非常高。每个样品的价格高达3,40元人民币。极大的限制了该产品的应用。近年来,在北京艾德莱为典型的研发人员的不懈努力下,大力改进创新,质量超过进口,尤其是纯度方面,全面超越进口可以轻松应用于芯片等纯度要求最高的应用。价格也只有进口的十分之一。因此该产品在国内大量替代进口产品,并迫使进口公司大幅度降价。

国家人类基因组南方研究中心遗传部全血DNA提取艾德莱和Qiagen产品测试结果:

2011年1月6日,国家基因组南方中心。本次测试5个样本,均为保存7,8年的陈旧血,且反复冻融,有的血颜色很淡,稀薄。这是艾德莱产品(DN01)500ul全血提取结果(2微升DNA上样,marker 4微升)。胶孔无任何残留。进一步优化操作步骤后,质量更好,轻松上芯片。

用户从前使用QIAGEN的盒子,大部分提的DNA胶图上孔里残留较多的蛋白,纯度差,产量偏低,不能上芯片。下图是一个QIAGEN DNA电泳图(上样孔明显杂质残留)。

结论:艾德莱的试剂盒性价比远超QIAGEN数倍,上芯片分析首选艾德莱全血提取试剂盒!

经过严格检测和对比实验,北京艾德莱生物产品DN3101 小量全血基因组DNA快速提取试剂盒的产量和纯度完全符合客户最严苛的芯片应用级要求。日前开始给复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室大规模供货,供货量达到3000人次/月。姜博士三天提了1500个陈旧血。客户评价说该款试剂盒的质量和稳定性完全达到世界领先水平,可以应用于基因芯片的要求。客户针对大规模用量大的情况下,进一步优化流程,300uL新鲜血及冻融过陈旧血,血块 提取6-10ug的全基因组DNA, 批处理48个样板只需要20分钟 脱盐,脱蛋白,用于基因芯片研究。

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