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一种基于手动芯片点样仪的快捷高效的转基因植物PCR-dot-blot鉴定法

关键词: 手动芯片点样仪 斑点杂交 转基因植物来源: 互联网

当前检测转基因植物的权威方法是分子杂交,其中Southern、Northern、Western杂交分别从整合、转录、翻译水平检测外源基因的行为,虽然说服力强,但是操作繁琐,费用较高,只适用于随机取样检测。如果用于批量检测,传统做法将会进一步显露出效率偏低、重复性差等缺点。

为建立高速度、高通量的检测方法,近年来发展了生物芯片技术,即将大量DNA或蛋白质等以预先设计的方式固定在载体上形成高密度阵列,利用核酸分子杂交、蛋白分子亲和原理对样品进行批量检测。该技术以其高效、快速的优势,有力地推动了后基类组时代医学及分子生物学各个领域的研究工作。

随着该项技术的普及,许多研究者希望能够用更简单的设备方便地制备个性化的芯片,以便更加灵活地为科研服务。

手动芯片点样仪(manua microarrayer)可以很好地满足这一需求,这类产品价格实惠、操作简单、重复性好,可以用来制作高质量的基因或蛋白芯片并且已经得到许多成功的结果,但在鉴定转基因植物方面尚未见报道。

本论文报道了一种基于手动芯片点样仪的快速、批量鉴定转基因植物的PCR-dot-blot新方法,旨在提高操作效率和可重复性。

首先对转基因烟草用外源目的基因特异性引物进行常规PCR鉴定,然后将该PCR产物回收纯化除去引物后,将仅为6nl的PCR产物(约100pgDNA)经变性后用手动芯片点样仪点于尼龙膜上,与生物素标记的外源目的基因片段进行斑点杂交,用很少的材料在短时间内就得到了比传统方法更为理想的杂交结果。

采用本方法可以对转基因植株进行批量检测,材料用量少、操作简单快捷、结果可信度高,与其它方法相比具有明显的优势。

1、材料和方法

1.1 植物材料和试剂

转基因烟草

用叶盘法将水稻的基因OSsec27p(GenBank Accession no.DQ434847)转入烟草(Nicotiana tabacum L.cv.W38),所得T0代植株在16h光照(25℃)/8h黑暗条件下培养。

1.2 方法

1.2.1 转基因植物的PCR鉴定

  随机挑取六株T0代转基因烟草,采用植物基因组DNA提取试剂盒(北京天根生化科技有限公司)提取基因组DNA模板,另外分别以未转化的野生型烟草基因组DNA以及含有OSsec27p的重组质粒作为阴性和阳性对照模板,使用OSsec27p基因特异性引物进行PCR扩增。

  取部分扩增产物进行1%琼脂糖凝胶电泳检测,检测无误后,从剩余产物中采用DNA产物纯化试剂盒(北京天根生化科技有限公司)回收纯化PCR产物,去除过量引物分子,用紫外分光光度计进行定量,均调整DNA浓度约为20ng/μl。

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