用来杀灭寄生在动植物体内或在木材、纤维、食品中腐生的有害真菌和土壤中真菌的药剂。与杀菌剂大致同义，但在专指以真菌为对象时而使用此词。在早所熟悉的药剂中，有对植物病有效的碱性铜盐〔如波尔多液（Bordeaux液）〕；治疗皮肤病的水杨酸、多硫化钙；用于防腐的氯化汞等。另一方面，霉菌与霉菌、霉菌和细菌之间常发生生物学颉颃现象，随着抗生素研究的发展，已发现在合成及天然物质中有很多有效物质，例如放线菌素A、芽孢菌霉素（来自枯草杆菌）、杀滴虫青霉素（来自青霉属）、棒曲霉素（来自曲霉属和青霉属等）、头孢菌素（来自头孢霉属）、放线酮等。