是说明遗传重组的分子机制方面的最有说服力的模型。它的原型来自 F． A． Janssens（ 1909）的交叉型学说。配对的双亲的染色单体之间发生断裂，如果染色单体互相发生交换并愈合，就会产生重组体。按照这个模型，在 DNA水平上也是一样，重组体 DNA就是由直接来自双亲的分子依上述情况组合起来的。到 60年代， M． Meselson等人所作的λ噬菌体的实验和富沢纯一等人用 T4 噬菌体所作的实验都验证了这一点。也就是将双亲 DNA各自用密度标记法（ dens－ ity labelling）加以标记以资区别，然后进行杂交，用密度梯度离心法分析子代的 DNA分子结果表明，重组体 DNA的密度，相当于从各个亲本得到的每一条所预期长度 DNA连接起来的分子密度。按照这一系列实验所导出的断裂愈合的分子模型遗传重组大致包括下列几个过程：起先配对的双螺旋分子中交错的合条链发生断裂，接下来氢键断裂，相对的各条链发生交换，然后再愈合起来。实际上，已经了解重组中间体在断裂愈合区域其双螺旋中的每一条链来自不同的亲本，就是说部分地变成杂合状态。这样，交错断裂愈合也能够说明过去很难说清的非相互（ non－ reciprcal）重组基因转换（ gene conversion）、插入（ insertion）和缺失（ deletion）等现象，因而是一个很好的模型。