指二个以上系统之间有一部分基因不同而其它基因都相同的纯系鼠，例如 C57BL／ 10（ H－ 2b ）系与 DBA／ 2（ H－ 2d ）系为不同的系统，但 C57BL／ 10鼠的 H－ 2基因用 DBA／ 2的同基因置换了的 B10． D2鼠，有 H－ 2d ，但其它基因与 C57BL／ 10是相同的，称 B10． D2与 C57BL／ 10为同族。这种仅 H－ 2基因不同的情况称同族抵抗鼠（ congenic resistant mou-se）。同族关系并不限与 H－ 2基因有关，例如， C3H系与 AKR系二者都为 H－ 2k ，但其它基因则不同，例如 T细胞特异抗原的 Thy 1抗原，在 C3H为 Thy 1． 2，而 AKR为 Thy 1． 1，然而只将 AKR的 Thy 1． 1用 C3H的 Thy 1． 2置换成的 AKR-Thy 1． 2与原来的 AKR系对 Thy 1抗原之外的基因来说是同族系。关于形成同族鼠，以 Thy 1抗原为例，用 C3H与 AKR交配，以后以 Thy 1． 2抗原之有无为指标，与 AKR回交（ 10世代以上），这样在 Thy 1抗原以外之基因，便都成了 AKR系。同族鼠只是特定的基因产物不同，所以一方的细胞或体液成分可使另一方免疫，可以产生对特定抗原的抗体或免疫反应细胞。这对现代免疫学是很大的贡献。