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PCR扩增产物的RFLP分析

关键词: PCR 扩增 产物 RFLP 分析来源: 互联网

一、PCR产物用各种限制性核酸内切酶酶解 将PCR扩增产物分装,并用下列不同的限制性核酸内切酶酶切 DR1 :Ava II,Pst I DR2 : Fok I,Sau 96,HpH I DR3 、8、11、12、14: Ava II,Fok I,Kpn I,Hae II,Sau96,SfaN I,Sac II,Apa I (1)将8ul PCR扩增产物与1ul相应的酶切缓冲液混合。 (2)取1ul相应的核酸内切酶(含1~2单位)。 (3)用吸头混匀。 (4) 在适当的温度中酶切1~3小时,为了确定DNA是否完全酶解,可以在酶切缓冲液中加入具有相应酶切位点的对照DNA(已知长度、酶切位点的数目和位置、酶切后的条带)。 二、PCR扩增产物酶解后的聚丙烯酰胺凝胶电泳 PCR扩增产物经上述限制性核酸内切酶酶切后,一般用水平电泳装置和12%聚丙烯酰胺凝胶进行电泳分析。 (1) 聚丙烯酰胺电泳凝胶的制备。 12%非变性聚丙烯酰胺凝胶的配制

凝胶成分 凝胶体积(ml)
125 100 80 40 25
10×TBE 12.5 10 8 4 2.5
双蒸水 38.15 30.52 24.4 12.2 7.63
30%丙烯酰胺 40.5 38.75 31 15.5 9.69
2%双丙烯酰胺 25 20 16 8 5
10%过硫酸铵(新鲜配制) 0.875 0.7 0.56 0.28 0.175
四甲基乙二胺(TEMED) 0.043 0.035 0.028 0.014 0.009

(2) 在酶解后的PCR扩增产物中加入8 ul 的加样缓冲液(0.05%丫啶橙,40%蔗糖),用加样器混匀。 (3) 将样本加入凝胶加样孔中,2000 V 电泳2.5~3小时。 (4) 用溴化乙锭或银染法显示DNA电泳条带。

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