2006年全国科学技术大会对国家中长期科技发展作出战略部署，中共中央、国务院发布了《关于实施科技规划纲要增强自主创新能力的决定》，提出必须深化科技体制改革和经济体制改革，进一步消除制约科技进步和创新的体制性、机制性障碍。稳定支持从事基础研究、前沿高技术研究和社会公益研究的科研机构，建立健全现代科研院所制度。2009年，温家宝同志在中国科学院建院60周年纪念大会上发表题为《让科技引领中国可持续发展》的重要讲话，提出要创造良好的环境，让科技工作者更加自由地讨论、更加专心地研究、更加自主地探索。全社会都要尊重知识、尊重人才、尊重实践、尊重创造，大力弘扬科学精神、传播科学思想、倡导科学方法、普及科学知识，全面提高自主创新能力和全民科学素质。由此可见，国家对于科技体制中存在的问题已有清醒的认识，并已着手深化科技体制改革，促进健康的科研文化建设。

　　目前科技改革的一种做法是从经费申请和使用者两方面入手，对科研经费与个体和单位利益的关联加大制约力度。如：正在逐步施行的严格科研经费预算和审查制度，可以有效降低经费使用的随意性，提高经费使用效率，但这同时也使科研人员科研经费的使用降低了必要的灵活性，特别是探索性较强的研究工作，更受到较多的牵制。一些主管部门加强对项目执行过程的监督，以确保研究计划按时、按质、按量完成，但这同时也给科研人员带来了较大的工作负担，使他们疲于应付各类检查、评估，降低了科研工作的效率。许多单位已将经费使用效率作为替代考核指标，考评科研经费的投入产出比，但是科研工作产出本身就很难有完善的量化指标;是否以科研论文的数量作为科研工作的“产量”，也是学术界有争议的问题。总体上看，上述策略有利有弊。因此，其实施效果，还有待实践的检验。