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新一批敲除小鼠序列数据存入基因银行

2007.8.10

美国得克萨斯州基因组医学研究所将其敲除小鼠库的超过275000个核苷酸序列信息存入了美国国立卫生研究院的基因银行。

以休斯敦为根据地的得克萨斯州基因组医学研究所于今年5月加入国际敲除小鼠协会。在美国国立卫生研究院号召在国际科学界广泛分享小鼠研究信息后,该研究所表示愿意向美国健康研究院提供基因序列信息。

得克萨斯州基因组医学研究所表示,这些信息是从C57BL/6小鼠胚胎干细胞库抽取,并且存入基因银行的基因组调查序列分部。

该研究所表示,这次存入新型的规模是自1982年基因银行创立以来最大一次。基因银行GenBank(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/),是美国国家卫生院(National Institute of Health, NIH)于1988年成立,1992年起,资料库即为Natioan Center for Biotechnology Information (NCBI)所管理。

美国国立卫生研究院(National Institutes of Health ,NIH)于2006年8月7日宣布将投资5千2百万美元,启动敲除小鼠计划(Knockout Mouse Project),目的是建立一个完善、免费的小鼠基因组突变基因数据库,并且用得到的基因突变小鼠品系帮助人类相关疾病研究。

NIH理事Elias A. Zerhouni说:“敲除小鼠是研究基因功能的有力工具,并且可以得到人类相关疾病动物模型。”基因敲除小鼠是被彻底“破坏”或者说敲除某个特定基因的小鼠品系。系统性地依次破坏小鼠基因组中20,000个基因中每个基因,有助于研究人员能够更好地了解每个基因在正常生理条件下和发育过程中的作用。更为重要的是,研究人员可以利用基因敲除小鼠研发能够为治疗癌症、心脏病、神经退行性疾病、糖尿病等人类遗传性疾病提供更为优秀的动物模型。最近发展的DNA重组技术以及小鼠基因组测序工作的完成将使敲除计划变的简易。

Wellcome Trust Sanger研究室负责5000个基因,VelociGene division of Regeneron研究室负责3500个基因,两个实验室都根据得到的小鼠基因组测序结果设计载体,然后获得每个基因相应的基因敲除小鼠干细胞。(实验动物为C57BL/6 品系小鼠)其他实验室将上述两个单位研制的干细胞和载体应用与生物医学研究。NIH打算将实验数据进行收集和整理,建立一个敲除小鼠计划数据中心。而且希望明年为敲除小鼠计划建立一个仓库,使所有实验材料能够对科研领域的每位成员开放。

NIH此项敲除小鼠计划,将与加拿大北美小鼠条件突变计划(North American Conditional Mouse Mutagenesis Project ,NorCOMM,生物通编者译)和欧洲小鼠突变计划(European Conditional Mouse Mutagenesis Program ,EUCOMM,生物通编者译)合作,以避免重复工作。这三项计划的目标都是获得编码小鼠大约20,000种蛋白的突变基因。三支研究小组达成协议:及时将研究结果公开发布。

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