正是因为如此，红外吸收光谱间接检测分子信号的根本性原理也造成了许多局限性，主要包括以下两点：
1）红外吸收光谱对光的透射要求较高，使得样品厚度在大多数情况下都小于10 μm，样品被高度稀释，灵敏度较低。
2）水对红外辐射具有强烈吸收，样品必须经常浓缩或干燥，导致制样过程繁琐。更重要的是，很多需要向样品中添加盐或者酸的水溶液来控制分子状态的样品难以测试，尤其是生物样品的红外分析难以为之。
自打进入实验室以来，我们就经常面对师兄师姐的教导，红外样品必须要干燥才能测试，不能含有水分，否则就会有水分子的干扰。但是，如果我的样品非得有水才能测试怎么办？有没有办法让红外不怕水呢？