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当23andMe弄混了96个样本之后……

2016.12.27

  基因检测,从无创产前到肿瘤伴随诊断,从天赋基因到个人全基因组测序,暂且不说这里面各种科学和商业的是是非非,且问一句:你如何确定你拿到的检测报告是你自己的,而不是别人的?

  父系祖源信息哪去了?

  2010年6月1日,有用户在一家基因检测公司的论坛发帖子“父系祖源信息没了?”,内容是:

  XXXX公司是不是要等一些时间才能提供父系祖源信息?我今晚收到通知邮件说我的结果已经好了。但看上去我的祖源分析结果是一位女性的。只有母系祖源分析结果,而且百分之百是非洲人,而我应该是欧洲人或者意大利人。

  这里所说的父系祖源和母系祖源,学术上分别称为Y染色体单倍群和线粒体单倍群。由于女性没有Y染色体,所以女性的基因检测结果中是测不出Y染色体单倍群,即父系祖源结果的。这位用户是男性,只看到了自己的母系祖源结果,因此猜测这个检测结果是女性的,或者是这家公司需要额外的时间来计算父系祖源。

  这个用户显然太天真了。

  隔壁老王?

  6月2日,又有用户在该公司的论坛发帖“我儿子不是我的?”,发帖人是一位女士。

  这位用户说,昨晚收到通知邮件,说她儿子和女儿的检测结果已经准备好了。她兴冲冲地去看结果,却震惊了。她女儿的结果看上去一切正常,但她儿子却携带血色素沉积症突变,而且几乎所有的性状分析结果都与实际不符。另外,更明显的一个问题是,基因亲缘关系分析结果显示,她跟她儿子没有血缘关系。

  这似乎不是隔壁老王的故事,而是隔壁张阿姨的故事了。

  真相

  到6月7日,包括WRIED、Science在内的各大媒体和学术期刊网站爆出一个新闻:著名个人基因检测公司,23andMe的用户收到了错误的检测结果。

  6月8日,23andMe在其官方博客发出公告(Update from 23andMe):我们确认最近有一张96孔板上的96个样品被我们的合作实验室弄混了,我们未来会增加更多的质控操作确保类似错误不再发生。

  6月9日,生命科学领域的知名媒体GenomeWeb也发出信息,23andMe的合作实验室LabCorp弄混了96个样本。LabCorp是当时美国第二大的医学检验公司。

  之后,用户继续在“我儿子不是我的”帖子下回帖,诸多用户站出来说自己是这次样品弄混的受害者,同时对23andMe的反应迟缓表示愤怒:

  “我并不奢望你从不出错,但我不想没人给我任何解释”

  即使在这个帖子里,居然还有美国人民在说:

  “无论如何,别让FDA掺和进来,否则我们就再也不能这样看到自己的基因组结果了”

  思考

  迄今依然是全球消费级个人基因组标杆的23andme在2010年,弄混了96个样本。其他公司为什么没有弄混样本?

  不是没有,而是没发现,或者消费者无法发现!

  为什么23andMe的用户会发现样本出错?因为23andMe提供了很多随时可以证伪的分析结果,比如性别、父系祖源、母系祖源、基因亲缘关系等。

  如果23andMe只是告诉用户乳腺癌遗传风险,用户不可能根据分析结果去判断样品是否弄混,因为这个风险概率的结果在个人层面是无法证伪的,甚至在大规模人群上也需要很长时间才能证伪。

  其他诸如天赋之类的检测结果,就更不可能证伪了,不仅仅是弄混样品,甚至就是不检测,直接出结果,都太可能被用户察觉。

  对于这类结果不可证伪的检测,只有通过额外支付费用,重复检测才有可能判断样本是否弄混。

  但如果,厂商完全不检测,直接根据人群基因组的突变频率出具正确率最高的结果呢?你可以把你家宠物狗的唾液送去测测,看是不是有结果。

  你以为这只是消费级基因检测的问题?太天真了。

  唐氏综合征,30岁以下孕妇的阳性率低于1/1000。按照一个收费1000元,错一个赔偿20万的方案来算,外加采样等成本,不做检测全部出阴性结果的毛利率可能超过50%。知道为什么CFDA当年要严管无创产前基因检测么?

  其实,这也不是基因检测独有的毛病,只是基因组的复杂性和科学上的不确定性,让这个问题更难以被一般人察觉。

  现在,问题来了:

  你还确信你手上捧着的肿瘤遗传风险、天赋基因、运动基因、美容基因、喝酒基因,乃至肠道微生物的检测结果是你自己的吗?

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