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食物中的成分如何影响重要的lncRNA表达?

2017.2.08

  尽管不断有突破性研究成果涌现,癌症依然还是令人谈虎色变的绝症。各种传说中的防癌食品一会儿备受热捧,一会儿又被各种科技网红辟谣扒皮,令人搞不清方向。不过常言道,research,research,就是要反反复复来来回回地search,不然那怎么叫re-search?众多网红的抗癌食物中,花椰菜始终是当仁不让的抗癌食谱首选。这不,又有一篇paper来解释其抗癌机制了,(是paper, 不是微信鸡汤哦)这回的新角度是从对lncRNA表达的影响上解释了从花椰菜中获得的萝卜硫素(甲基亚硫酰基丁烷,Sulforaphane,SFN)如何减弱癌症相关lncRNA的表达,还用上了网红技术CRISPR来验证结果。

  纳尼,食物还能影响lncRNA?!长知识了!

  长的非编码RNA(lncRNA)已经在癌症发展和进展中显示出重要性。饮食对lncRNA表达的影响在很大程度上是未知的。传说花椰菜等蔬菜获得的萝卜硫素(甲基亚硫酰基丁烷,Sulforaphane,SFN)可以预防和抑制癌症形成。俄勒冈州立大学的研究人员就本着严谨的态度用实验,用paper论证了SFN减弱癌症相关的lncRNAs的表达的假说。

  实验思路:

  研究人员分别用15μMSFN或二甲基亚砜处理的前列腺癌细胞,并分析了癌细胞和正常人前列腺上皮细胞的全基因组RNA测序数据。

  实验结果

  1. SFN显著改变每种细胞类型中约100种lncRNA的表达,并能调节使一些在癌细胞中差异表达的lncRNA恢复正常表达! SFN介导的lncRNA表达的改变与调节细胞周期,信号转导和代谢的基因相关。

  2. LINC01116在几种癌症中呈现过表达,并且在SFN处理后在转录水平上被抑制,因而研究人员重点对其功能进行进一步地研究。 利用siRNA敲低LINC01116表达使得前列腺癌细胞的增殖降低,并显著上调几种基因,包括GAPDH(调节糖酵解),MAP1LC3B2(自噬)和H2AFY(染色质结构)。当通过CRISPR / CAS9方法破坏LINC01116基因,使得癌细胞形成集落的能力降低四倍。这个结果进一步支持PC-3细胞中LINC01116的致癌功能。

  3. 研究人员还鉴别出一种新的LINC01116亚型,并从生物信息方法来探究LINC01116通过ssRNA:dsDNA方式与目标基因相互作用形成三重体的可能性。数据显示,来自饮食的成分可以影响功能重要的lncRNAs的表达,并提示了一种SFN可以预防和抑制前列腺癌的新机制。

  虽然几次实验结果距离“公认”抗癌食物还差得远,不过,食物能影响个人体型乃至健康,除了大热的肠道菌途径,lncRNA也可能是途径之一哦,年纪大的男士们不妨多吃吃花椰菜。

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