植物育种实用知识点
1、植物育种用育种值
不少人在用配合力，配合力和育种值的区别是应该认真思考的一个问题，如何在植物育种中使用育种值，来自动物育种的成功应用，更来自数量遗传学知识本身。在某种程度上，育种值是一般配合力的更科学更牢靠应用，博思公司提供的《配合力分析与BLUP育种值分析的结果比较.pdf》，可以很清楚的看到这一点。
如果您从事植物育种，没有听说过“植物育种用育种值”，建议了解；如果您在用一般配合力育种，建议尝试育种值。
BLUP育种值模型（线性混合模型）采用了育种值构建而不是一般配合力+特殊配合力，是值得思考的一个问题。
提倡“植物育种用育种值”不是否定配合力，是提升配合力的使用。
2、方差分析缺区问题
缺区问题很复杂，不同的试验设计都会遇到这个问题，认为用线性混合模型就可以解决问题的想法不可靠，客观上存在缺区到什么程度，不能进行方差分析的临界问题，从品种试验来说，品种不种出来，谁都不知道它会长成啥样，这不是线性混合模型能解决的问题，也是估计法要注意的，缺区导致模型中相关效应平均数无法计算，可以作为是否能进行方差分析的一个考察条件，该考察条件得到了SAS9.1 ANOVA过程的验证。
3、品种稳定性适宜性问题
品种布点试验区域试验，花钱多，解决的问题，主要是品种稳定性和适宜性问题。在比较了多种稳定性方法后，我们推荐相对平均偏差RSD这个基本统计量。该方法简单到甚至都不好意思说是一种数据分析方法，但是RSD可以准确地衡量品种布点试验中，品种间的稳定性优劣，如果你担心RSD比较的科学性，尽可以跟任何一种稳定性分析方法的结果去对比。
品种适宜性问题，从我们比较的结果来看，立足试验中的地点效应去衡量品种适宜性，这样的分析思想更可靠，比如环境指数。稳定性分析方法不牢靠，各种图示没有意义。
4、遗传力问题
遗传力，这个概念是错误的，应该是遗传率。从遗传率公式可以准确理解其实质。构建在错误概念“遗传力”基础上的各种方法公式都应慎重考虑其育种实用性和育种价值。
5、一次重复的多点试验如何进行方差分析
一次重复，其实并没有重复，所以无法计算得到试验随机误差,将地点当成区组，把多点试验缩为单因素随机完全区组进行统计分析。
6、没有重复的多点试验如何进行方差分析
n个材料安排在v个不同地点，进行产量试验，没有设置重复，使用单因素随机区组（增广设计）进行数据分析，用试验中的对照来充当考察品种，估计试验误差。这样安排多点品种试验，省钱、高效、又可以保证高的试验质量，多年数据还可以考察稳定性、适宜性，是个不错的经营策略，会是个趋势。
7、BLUP混合线性模型不是万能的
BLUP仅是一套数据分析的方法，甚至可以说成就是解了个方程组，线性混合模型的应用要点不在于算法的更科学更复杂，而在于构建的模型是不是更符合要解决问题的内在规律。主张植物育种值采用BULP育种值模型（BS模型），一来是因为动物育种已经用育种实际成效验证了其有效性，二来，就是基于基因加性效应选择的育种值线性模型，目前来看更符合育种选择规律。
在动植物育种领域，不利用系谱的BLUP混合线性模型，没有价值。
