会议开幕式由李镇清主持，植物所副所长张立新致欢迎辞，中国生物数学学会副理事长崔景安教授及日本生物数学学会会长Yasuhiro Takeuchi发表致辞。之后进行了为期4天的学术交流。
本次会议强调数学家与生物学家共同探讨现代生物学问题，及其所需要的数学和计算方法和数学生物学中的应用。与会人员共同探讨现代生物学问题及其所需要的数学和计算方法；交流和展望数学生物学研究的最新进展和发展方向。会议共有特邀报告34个，分组报告28个，墙报展示13个。大会报告有从事生物数学研究或相关课题研究的国内外著名专家介绍各自群体的研究成果，交流讨论生物数学研究的前沿信息。著名生态学家和理论生物学家Y. Iwasa教授（J. Theoretical Biology杂志主编， J. Math. Biol. 和Math. Biosci.杂志副主编）和北京师范大学的张大勇教授分别做了题为“Evolution of masting -- synchronized and intermittent reproduction of trees”和“Neutral and nearly neutral models of biodiversity”的特邀报告。分组报告和墙报的主题包括：流行病学、物种的进化对策、生态学中各种稳定性和分支、反应扩散、空间格局等复杂现象的分析和模拟。针对不同形式的报告，与会学者就相关问题展开了热烈的讨论和广泛的交流。大会于21日顺利闭幕。