对于一些意料之外的结果，用户可进一步挖掘原始数据，以验证得到的定量和定性分析结果。打开Investigate功能选项卡(见前页图-2)即可出现直接由UPLC/MS原始数据产生的色谱和质谱结果的图形和表格显示区。这些视图还支持用户进行开放式研究，如：提取某些特定质量的峰、谱图加和、运用背景校正等。反之，可通过处理后的某个峰来分析其对应的原始数据。为使该图简单化，选定相同的T6肽段进行更进一步研究。
n 图2中的三维图形浏览工具(左上、二维视图、2+离子智能变焦)表明这个峰的质谱数据中没有任何干扰，并突出显示了2+离子的同位素峰检测结果。
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更为重要的是，T6相关的提取离子色谱图(左下)、加和图谱(右上、右中)和处理后的质谱鉴定数据(右下)都可通过使用与组成窗口有关的可选择命令自动生成(图-3)。n
对UPLC/MS原始数据中的各个峰进行分析的功能不仅可缩短用户查看其它图谱进行结果验证的时间，还可将实验室进行肽图分析的过程标准化。