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琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的...(二)

2020.4.13

2. 筛选修饰蛋白进行验证并探究修饰位点功能

进一步,作者对6个候选琥珀酰化蛋白进行验证(LuxS、PkG等),先通过Co-IP富集候选的修饰蛋白,随后利用琥珀酰化抗体进行WB,证明了这些蛋白确实发生了琥珀酰化修饰。随后,作者锁定了一个调节群体感应自诱导剂AI-2的合成酶-----LuxS进行深入研究,通过对LuxS的修饰位点K23R与K30R进行突变,研究发现LuxS蛋白的琥珀酰化修饰正调控该蛋白酶的活性,从而促进了AI-2的合成及其与其它细菌间的交流。

图7

图8

3. LuxS位点突变菌株的代谢组分析

作者进一步对LuxS位点突变菌株进行代谢组分析,研究一共检测到271种代谢物。组学结果表明, LuxS蛋白酶影响氨基酸、脂肪酸和硫代谢,LuxS通过可逆调控其K23、K30位点的琥珀酰化状态,巧妙地控制氨基酸、脂肪酸和硫代谢等中心代谢途径。

图9

图10

小编总结:

研究作者利用琥珀酰化修饰组进行分析与筛选,目的是找到感兴趣的蛋白进一步分析。由于酰化修饰对代谢的广泛调节,作者最后也将目标放在一个S-核糖同型半胱氨酸裂合酶(LuxS)上,其首先证明了该酶上的修饰位点对表型的影响。为了进一步揭示其更多潜在功能,作者由进行了代谢组学,发现LuxS上的K30琥珀酰化可能抑制luxs基因在活化甲基循环(amc)的作用,并且k23和k30位点都参与氨基酸代谢。最终,研究揭示了嗜水气蛋白菌中,LuxS酶的赖氨酸琥珀酸化修饰调控着细菌的生长及对外界动态环境的适应机制。

本文是一篇思路简单清晰、逻辑顺畅的文章,值得我们借鉴的是,做完修饰组学之后,锁定目标蛋白,可进一步进行代谢组的分析,这也是提升文章质量的好方法。目前,中科新生命无论在修饰组学还是代谢组学方面,均有专业的技术平台保证,且拥有多篇高水平客户文献,欢迎感兴趣的老师前来咨询。


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