监管体系逐步健全，质量安全监管格局初步形成。2008年农业部成立了农产品质量安全监管局，20多个省厅相继成立了农产品质量安全专门监管机构，地市县级农产品质量安全监管机构也逐步建立。2009年农业部将乡镇农产品质量安全监管服务机构建设纳入到农技推广服务体系建设中统一规划，力争3年内普遍健全乡镇或区域性农产品质量安全监管服务机构，实现省、市、县三级农业部门有专门监管机构、乡镇一级“有职能、有人员”的监管工作体系。
检测体系建设全面加强，质量安全监测不断深化。全面实施了《全国农产品质量安全检验检测体系建设规划(2006-2010年)》，总投资59.06亿元，建设了1个部级农产品质量标准与检测技术研究中心、42个部级专业性农产品质检中心、15个部级区域性农产品质检中心、36个省级综合性农产品质检中心和1200个县级农产品质检站，各类检测技术人员由1.96万名增至2.3万名，增幅17%。组织制定了二期建设规划，全面加强市、县基层检验检测能力。深入实施了普查、例行监测、监督抽查以及农兽药残留监控、水产品药残监控、饲料及饲料添加剂监控等监控计划，针对大中城市消费安全的例行监测品种已包括6大类101种，检测参数达68项，覆盖全国259个城市，形成了涵盖全国主要城市、涉及主要农产品的监测网络，风险防范和预警处置能力不断提高。