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973首席科学家最新文章解析疾病发生机制

2007.7.25

附:
shRNA

体内表达shRNA(短发夹RNA)的设计

1.克隆到shRNA表达载体中的shRNA包括两个短反向重复序列,中间由一茎环(loop)序列分隔的,组成发夹结构,由polⅢ启动子控制。随后在连上5-6个T作为RNA聚合酶Ⅲ的转录终止子。

2.两个互补的寡核苷酸两端须带有限制性酶切位点。

3.Stratagene发现29个寡核苷酸较之原先推荐的23个寡核苷酸可以更有效的抑制目的基因。

4.在启动子下游的酶切位点下方紧连一个C,使插入片段和启动子有一定空间间隔以确保转录的发生。

5.ShRNA目的序列的第一个碱基必须是G以确保RNA聚合酶转录。如果选择的目的序列不以G开头,必须在紧连正义链的上游加一个G。

6.ShRNA插入片段中的茎环应当靠近寡核苷酸的中央。不同大小和核苷酸序列的茎环都被成功的运用过。其中包含一个独特的限制性酶切位点的茎环利于检测带有shRNA插入片段的克隆。在比较了众多不同长度和序列的茎环,5'TCAAGAG3'序列最为有效。

7.5-6个T必须放置在shRNA插入片段尾部以确保RNA聚合酶III终止转录。

8.在正义链和反义链序列上不能出现连续3个或以上的T。这可能导致shRNA转录的提前终止。

陈国强
男,博士,教授,国家重点基础研究(973)计划首席科学家, 细胞分化与凋亡教育部重点实验室主任,上海交通大学医学院病理生理学教研室主任、中国科学院上海生命科学研究院健康科学研究所肿瘤功能基因组学研究室主任, 《癌症》杂志副主编、《中华医学杂志》和《肿瘤防治杂志》等编委,《BLOOD》《LEUKEMIA》等杂志特约审稿人。

1996年7月在上海第二医科大学获医学博士学位,并分别于1997年和1999-2001年在法国巴黎Saint-Louis医院和美国Mount-Saint医学院从事合作研究。

多年来,他作为国家973计划、国家杰出青年科学基金、中科院百人计划等项目负责人,一直致力于白血病细胞分化和凋亡的分子机制和治疗学基础研究,他所从事的三氧化二砷治疗急性早幼粒细胞性白血病(APL)的基础和临床研究工作引起国际同行的高度重视。

2002年5月回国后,任上海交通大学医学院病理生理学教研室主任。三年来,他使一个当时只有十位职工、不到1万元的科研资产、更没有科研课题的教研室实现了跨越式的发展。现在已经拥有20多位固定员工和20多位研究生;科研固定资产和科研课题经费双双超过千万大关,并在国际重要学术刊物上发表近30篇论著,其中极大多数发表在影响因子大于5的刊物上。几年来,他在发现低氧诱导白血病细胞分化的基础上,提出以“低氧-低氧诱导因子(HIF-1a)-C/EBPa”为主轴的白血病细胞分化信号机制;报道磷脂爬行酶介导白血病分化,并就其表达调控机制提出新发现;发现新型喜树碱衍生物NSC606985在低浓度下即可诱导白血病细胞凋亡,并对其诱导细胞凋亡的机制进行了研究,展示良好的药物研发前景。此外,在利用蛋白质组学技术研究和白血病相关蛋白的功能方面也取得重要进展。相关研究成果获得上海医学科技一等奖、上海市科技进步一等奖和中华医学一等奖。

迄今,他先后在国际重要学术期刊如BLOOD,JBC, ONCOGENE,LEUKEMIA, PNAS, CANCER RES等发表40多篇论著。自97年以来,在全国单篇论文引用数统计排名中始终处于前八位,共达2200余次。他也先后获得国家自然科学二等奖、上海市科技进步一等奖、杜邦科技创新奖、中国青年科技奖、上海医学科技一等奖、中华医学科技奖等学术奖励和全国和上海市劳动模范、新世纪国家百千万人才工程首批入选者、上海科技英才、上海市优秀学科带头人、上海市自然科学牡丹奖等荣誉称号。

目前的研究重点为(1)急性粒细胞性白血病分化和凋亡机制研究;(2)PLSCR1生物学功能学研究;(3)肿瘤化学生物学研究;(4)白血病相关蛋白AML1-ETO引起的生物学功能研究;(5)肿瘤蛋白质组学研究。

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