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总RNA提取实验

2020.8.11

实验方法原理 GTC和N-十二烷基肌氨酸钠的联合使用,将促使核蛋白复合体的解离,使RNA 与蛋白质分离,并将RNA 释放到溶液中。而进一步从复合体中纯化RNA ,则根据Chomc zynski和Sacchi的一步快速抽提法进行,采用酸性酚-氯仿混合液抽提。低pH值的酚将使RNA 进入水相,这样使其与仍留在有机相中的蛋白质和DNA分离。水相中的RNA 可用异丙醇沉淀浓缩。进一步将上述RNA 沉淀复溶于GTC溶液中,接着用异丙醇进行二次沉淀,随后用乙醇洗涤沉淀,即可去除所有残留的蛋白质和无机盐,而RNA 中如含无机盐,则有可能对以后操作中的一些酶促反应产生抑制。

实验材料 微生物动物细胞植物组织

试剂、试剂盒 RNA 提取试剂盒焦碳酸二乙酯乙醇

仪器、耗材 恒温水浴冷冻高速离心机紫外分光光度计取液器电泳仪电泳槽

实验步骤

一、细胞或组织破碎

 

1.  微生物材料

 

(1)发酵3~4天(或对数生长期)的菌体,离心收集菌丝体(动植物材料无需此步处理)。

 

(2)用经DEPC处理的水洗菌丝体2~3次,并尽量除去残存的水。

 

(3)加液氮充分研磨,使其成为粉末,以释放RNA。

 

(4)研磨后的样品转移至12 ml 变性液的容器中匀浆。

 

2.  动植物细胞培养材料 (适用的样品量为细胞:108)

 

(1)细胞或组织培养:按常规方法进行。

 

(2)深层悬浮培养细胞的破碎。

 

①细胞收集:含一定浓度的细胞培养液置于无菌离心管中,4℃,3 000 g 离心5分钟。

 

②细胞洗涤:上步沉淀用25 ml 灭菌后冰冻的1×PBS缓冲液洗涤,然后4℃,3 000 g 离心5分钟。

 

③细胞破碎:在沉淀细胞中加入15 ml 预冷的变性液,用无菌处理过的匀浆器匀浆。

 

3.  表面培养细胞的破碎

 

(1)确定培养瓶数量,使选定的各培养瓶细胞累加后总量达108。

 

(2)细胞收集:将培养液倒掉,用预冷的无菌PBS缓冲液洗涤一次,在培养瓶中加入8 ml 预冷变性液。


(3)转动培养瓶,使细胞溶解,此时可见粘度加大。

 

(4)用无菌吸管将第一个培养瓶中的液体吸入第二个培养瓶,旋转,溶解细胞,再吸入第三个培养瓶,以此类推。


(5)直到将所选定的培养瓶全部洗涤一次,然后从第一个培养瓶开始再加入4毫升上述变性液,将所有培养瓶洗一次。

 

(6)将上述12 ml 含细胞的变性液转移至一50 ml 无菌离心管中,匀浆破碎细胞。

 

4.  植物组织破碎 (适用的样品量为0.05 g 组织)

 

(1)将600 ul 变性液置于1.5 ml 离心管中,将此离心管放于冰浴中5分钟。

 

(2)将0.05 g 新鲜组织用液氮冰冻。

 

(3)在液氮下,研磨组织块。

 

(4)待液氮挥发后,将上述分散的组织转移至无菌离心管中。

 

5.  动物组织破碎 (适用的样品量为1 g 组织)

 

(1)将12 ml 变性液置于50 ml 离心管中,将此离心管放于冰浴中5分钟。

 

(2)在上述管中加入1 g 新鲜或冰冻动物组织,匀浆粉碎。

 

二、RNA 的抽提

 

1.  在经变性液匀浆的细胞或组织600 ul+60 ul pH4.0的2 M 乙酸钠彻底混匀,可用漩涡振荡器。

 

2.  600 ul 酚\氯仿\异戊醇(25\24\1),彻底混匀或漩涡振荡器振荡10秒。

 

3.  冰裕中10~15分钟,离心,4℃,10 000 g,20分钟。

 

4.  上层水相吸至无菌离心管中加等体积的异丙醇,-70℃,30分钟沉淀RNA。

 

5.  离心4℃,10 000 g,20分钟。

 

6.  沉淀RNA ,冷冻干燥15分钟 , RNA 沉淀重新溶于300 ul 变性液中,可振荡(有时为了帮助溶解,可在65℃加热,但时间应极短)。

 

7.  60 ul pH4.0的2 M 乙酸钠彻底混匀,可用漩涡振荡器。

 

8.  600 ul 酚\氯仿\异戊醇(25\24\1),彻底混匀或漩涡振荡器振荡10秒。

 

9.  冰裕中10~15分钟,离心,4℃,10 000 g,20分钟。

 

10.  上层水相吸至无菌离心管中。

 

11.  等体积异丙醇二次沉淀(-70℃,30分钟),75%乙醇洗沉淀,沉淀冷冻干燥。


12.  复溶于去RNA 酶的水中(对于准备长期保存的RNA 可加入pH 5.0的乙酸钠至终浓度为0.25 M,再加入2.5体积的乙醇,-70℃保存。)。

 

注意事项


1.  研磨组织块用于RNA 提取的样品,必须是新鲜的细胞或组织,如采样后,不能立即用于提取则样品应用液氮速冻并贮于-70℃的冰箱中保存。


2.  变性液及相应的离心管需预冷。


其他


1.  变性液组成


25 g异硫氰酸胍溶于33 ml CSB(42 mM pH4.0乙酸钠、0.83%十二烷基肌氨酸钠、0.2 mM β-巯基乙醇),65℃溶解,过滤灭菌,4℃预冷。

 

2.  酸性酚配制


55℃时,500 g酚溶入500 ml 50 mM,pH4.0乙酸钠,混匀,静止分层后,去上清,再反复加500 ml 50 mM,pH4.0乙酸钠,直到pH<4.1。

 


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