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宝予德HF extract高通量组织研磨仪在样本研磨上的应用

2021.3.08

早在2019年12月之前,新冠病毒可能已经在人群“隐秘传播”(cryptic spread)阶段发生了一些关键突变。也就是说,这种新型病毒在人群中出现的时间可能比设想的更早,甚至不一定最早出现在武汉。


上述推测结论来自两位病毒学专家:澳大利亚悉尼大学玛丽·巴希尔传染病和生物安全研究所的爱德华·霍尔姆斯(Edward C. Holmes)教授,以及中国疾控中心(CDC)传染病预防控制所研究员、复旦大学附属上海市公共卫生临床中心兼职教授张永振。当地时间3月26日,这两位“老搭档”联合在顶级学术期刊《细胞》(CELL)上发表了一篇评论“A Genomic Perspective on the Origin and Emergence of SARS-CoV-2”
 

 


武汉华南海鲜市场的起源不确定性:几年前探访过市场


此前的观察显示,第一批报告的COVID-19病例和武汉的华南海鲜野生动物市场有关联。值得一提的是,张永振、霍尔姆斯等人曾在2014年亲身探访过该市场,霍尔姆斯提供的一张照片显示,当时该市场即出售野生动物。




图片来源:该照片由Edward C. Holmes提供,拍摄于2014年10月,当时两位作者一起参观了市场。
他们在文章中提到,在此次疫情暴发的时候那里仍然可以买到多种哺乳动物。然而,由于并非所有的早期案例都与市场有关,新冠病毒出现的故事可能比最初推测的更为复杂。

中国疾控中心此前获得了来自该市场“环境样本”(比如物体表面)的基因组序列。系统发育分析表明,它们与从武汉最早的病人身上采集的病毒密切相关。


张永振等人表示,虽然这再次表明,华南海鲜市场在病毒出现中发挥了重要作用,但很难明确这些环境样本中的病毒来自该市场的动物还是当时已在无意中传播的人。“不幸的是,随着市场的关闭,目前明显缺乏直接的动物样本,这可能意味着很难、甚至不可能准确地识别出任何动物宿主。”

环境样本的含有复杂的有机质、无机盐等杂质,需要用研磨珠对样本进行处理,并且利用IRT 技术对样本的有机物、无机盐进行分离,才能保证样本的正常扩增。

宝予德HF extract高通量组织研磨仪是针对现代实验室应用而设计生产的一款全面型应用的研磨仪,它可对小量、大批次样品,如植物、动物组织细胞以及小量固体样品、环境样本进行快速地干磨、湿磨及冷冻研磨。

环境样本核酸提取前处理过程图示:


经研磨仪处理后的冠状病毒检测结果:


a:不经研磨和IRT去抑制物处理扩增结果

b:研磨仪处理,经过IRT去抑制物进行扩增结果

 
由上可见:环境样本需要经过HF extract高通量研磨仪处理后,经过IRT技术沉淀杂质,才能真正的检测出结果,提高阳性率,避免漏检。


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