另据中国地质科学院水文环境地质环境研究所完成的《华北平原地下水污染调查评价》显示，华北平原浅层地下水综合质量整体较差，且污染较为严重，未受污染的地下水仅占采样点的55.87%，遭受不同程度污染的地下水高达44.13%。
方案指出，海河流域受污染地表水入渗补给是地下水污染的重要原因，重点污染源排放也是造成地下水污染的重要原因。此外，华北平原地下水环境监管能力低下、监测网络不健全、管理制度不完善等也直接影响地下水污染防治工作。
全国人大代表、国土资源部应用地球化学室主任王学求表示，目前当务之急是要控制新污染源的产生，对一些污染严重的新建项目，坚决不予审批，尤其是小型的造纸、化工、炼油等项目。对已上的项目，建立污水处理项目，对一些污染较为严重的企业要实行限期治理。要坚决杜绝因设施、管理等方面造成污染现象的发生。
根据地下水系统特征，方案将华北平原及其地下水重要补给区划分为30个相对独立的污染防治单元，明确主要工作任务：加强地下水环境监测，建立华北平原地下水质量监测网;保障地下水饮用水源安全，严格地下水饮用水源环境执法，分类防治超标地下水饮用水源;强化重点污染源和重点区域污染防治，加强地表水污染防控，加大对重点污染源废水排放和堆放场地污染物渗漏等防治力度，积极推进重金属、有机物和氨氮、硝酸盐氮和亚硝酸盐氮等污染较严重区域的地下水污染综合防治。