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如何区分引物二聚体和目的条带?

2019.9.24

因为引物二聚体的大小从几十 bp 至几百 bp 不等,所以当你的目的条带的分子量比较小的时候,电泳后所看到的结果不一定是目的条带,很有可能是引物二聚体,所以我们需要一个有效的方法来区分二者。当我们对引物二聚体形成的本质了解了之后,想要区分二者其实并不难,我相信大家看到这里的时候已经知道了引物二聚体形成的本质了,但是我还要强调一遍:引物二聚体形成的本质其实就是引物之间或者引物自身的 3’ 端区域存在部分互补结合。


也就是说,引物的形成是不需要模板的参与的,所以我们只需要在电泳的时候添加一组对照就可以有效的判断是否有引物二聚体的形成,以及如果有引物二聚体的形成,它的分子量是多大,从而区分开引物二聚体和目的产物。


这个对照就是:模板用 H2O 替代,其他的都一样。这样的话,如果这个泳道有条带出现,那说明形成了引物二聚体(当然前提就是该体系没有被模板污染)。从这里也可以看出设置对照的重要性,一个巧妙的对照往往可以达到事半功倍的效果。


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