CAA | 科普：自动化细菌鉴定
自动化细菌鉴定系统MicroStation是美国80年代后期在大量试验基础上研制成功的一种专门用于细菌诊断和鉴定的新型专家系统，该系统将细菌的生理生化过程的检测与先进的计算机管理手段有机结合起来，通过一些辅助软件和设备，自动阅读待测细菌对各种碳源代谢情况的数据，并自动输入计算机的有关数据库，自动完成数据库的检索，细菌鉴定，结果显示，结果打印等过程。
该系统的使用，很大程度上简化了传统的细菌鉴定程序而无需复杂的预备和后续试验。该系统是一种快速准确实用，并具有较高标准化程度的全新鉴定系统。系统主要由系统软件，计算机系统，高精度阅读器，测量测试板及其他的辅助设备组成。其中高精度阅读器为本系统自动检测待测细菌对微量测试版上各个碳源代谢数据的专用设备。在计算机的控制下，阅读机自动阅读微量测试版上每个小孔上的光密度值，并将读取的数据自动输入计算机，实现数据检测－数据库检索－结果鉴定整个过程的自动化。
自动化细菌鉴定系统
系统操作比较简单，首先将待测细菌分离、纯化。这个过程是鉴定工作的最基础和最重要的环节。通过分离培养，从试样中分离出细菌，然后利用单克隆纯化技术，对分离出的细菌进行纯化，获得待测的纯培养。采用经典的革兰氏染色体方法，确定待测菌株是革兰氏阴性菌还是革兰氏阳性菌，根据革兰氏染色体反应结果，按照不同的步骤进行下一步操作。对在革兰氏染色体反应中表现阴性的细菌，选用TSA对其进行标准化预培，对在革兰氏染色体反应中表现阳性的细菌，选用BUGM对其进行标准化预培，对于绝大多数细菌而言，培养时间为4～18小时比较适宜，这样，既可以防止细菌的老化而失去代谢活性，又能保证有充足的菌量供鉴定使用。将微量测试版从冷藏条件下取出，在28～35度环境下进行预热，然后，将配置好的标准悬液倒入专用储液池中，用八孔移液枪将细菌悬液滴加到相应微量测试板上的每一个孔内并对孔加入无菌生理盐水。将已滴加菌悬液的微量测试版加盖标记，放入一定温度的培养箱中进行培养，培养期间使培养箱内始终保持一定的湿度，以防止微量测试版上小孔，特别是边缘部分小孔内水分的蒸发。培养温度因细菌类群不同而有差异，对于绝大多数植物病原细菌来说，在30度条件下培养比较合适。培养了4小时后，用高精度阅读器读板，阅读器读的数据通过与计算机的接口自动输入计算机，经过数据库检索，最后将鉴定结果显示于屏幕，使用者可以根据需要将结果进行打印后做其他的分析。对于代谢过程缓慢的菌株，继续培养至24小时后读板，系统将在24小时数据库中进行检索，得出鉴定结果。
系统还具有自动校准和鉴定结果的功能。利用4小时数据库鉴定细菌时，相识值不低于0.5方即可有鉴定结果，不符合上述条件。系统均以没有鉴定结果结论。我们可以把经大量实验研究，结果稳定，但系统现有数据库中所没有的细菌代谢数据存入用户数据库中，作为标准数据供以后鉴定参考。这对于具有检疫重要性的细菌种类来说更具意义。
该系统的细菌数据库及微生物各个学科的细菌种类，除了植物病源细菌外，还包括食品，发酵，水质，制药，环境，土壤，海洋等领域的细菌及人类和动物病源原细菌，其广泛而庞大的数据库资源无疑具有进一步利用的价值。另外，该鉴定系统庞大的数据库可以提供大量典型细菌菌株生化代谢的有关信息，借助这套系统，可以了解很多我们不熟悉的细菌的生理生化特性；通过系统提供的细菌见多维亲缘关系图解，我们可以从多个角度分析认识细菌见复杂的亲缘关系，了解细菌分类的最新进展。
